以材雄稱。
少事秦王幕府，從征讨有功，擢累左虞候、車騎将軍，封全椒縣子。
預誅隐太子尤力。
王即位，拜左衛将軍，進封潞國公，邑千戶。
貞觀四年，遷兵部
李靖讨吐谷渾，以君集為積石道行軍總管。
師次鄯州，議所向。
君集曰：“王師已至，而賊不走險，天贊我也。
若以一精一兵掩不備，彼不我虞，必有大利。
若遁岨山谷，克之實難。
”靖然其計，簡銳士，約赍深入，追及其衆于庫山，大戰，破之，進會大非川，平其國。
會诏世封功臣，授陳州刺史，更封陳；群臣不願封，進吏部尚書。
君集本以行伍奮，不知學；後貴，益自喜，好書。
及典選，分明課最，有譽于時。
吐蕃圍松州，授當彌道行軍大總管以擊之。
高昌不臣，拜交河道行軍大總管出讨。
王曲文泰笑曰：“唐去我七千裡，碛鹵二千裡無水草，冬風裂肌，夏風如焚，行賈至者百之一，安能緻大兵乎？使能頓吾城下一再旬，食盡當潰，吾且系而虜之。
”君集次碛口，而文泰死，子智盛襲位。
進營柳谷，候騎言國方葬死君，諸将請襲之。
君集曰：“不可，天子以高昌驕慢，使吾龔行天罰，今襲人于墟墓間，非問罪也。
”于是鼓而前。
賊嬰城自守，遣谕之，不下。
乃刊木塞塹，引撞車毀其堞，飛石如雨，所向無敢當，因拔其城，俘男一女七千，進圍都城，初，文泰與西突厥欲谷設約，有急相援。
及是，欲谷設益懼，西走，智盛失援，乃降。
高昌平，君集刻石紀功還。
初，君集配沒罪人不以聞，又私取珍寶、婦女，将士因亦盜入，不能制。
及還京師，有司劾之，诏君集詣獄簿對。
中書侍郎岑文本谏曰：“高昌之罪，議者以其遐遠，欲置度外，唯陛下奮獨見之明，授決勝之略，君集得指期平殄。
今推勞将帥，從征之人悉蒙重賞，未逾數日，更以屬吏，天下聞之，謂陛下錄過遺功，無以勸後。
且古之出師，克敵有重賞，不勝蒙顯戮。
當其有功也，雖貪财縱一欲，尚蒙爵邑；其無功也，雖勤躬潔己，不免鈇钺。
故曰：‘記人之功，忘人之過，宜為君者也。
’昔李廣利貪不一愛一卒，陳湯盜所收康居财物，二主皆赦其罪，封侯賜金。
夫将帥之臣，廉慎少而貪沒多。
軍法曰：‘使智，使勇，使貪，使愚。
故智者樂立其功，勇者好行其志，貪者邀趨其利，愚者不計其死。
’是以前聖使人，必收所長而棄所短。
陛下宜申宥君集，俾複朝列，以勸有功。
”帝寤，釋不問。
君集自恃有功，以它罪被系，居怏怏不平。
會張亮出洛州都督，君集謬激說曰：“何為見排？”亮曰：“公排我，尚誰咎？”君集曰：“我平一國還，觸天子嗔，何能排君？”因攘袂曰：“郁郁不可活，能反乎？當與公反。
”亮密以聞。
帝曰：“卿與君集皆功臣，今獨相語而無左驗，奈何？”秘不發，待君集如初。
皇太子承乾數有過，慮廢，知君集犯望，因其婿賀蘭楚石為千牛，私引君集入，問自安計。
君集舉手謂曰：“此手當為殿下用之。
”又遣楚石語承乾曰：“魏王得一愛一，陛下若有诏召，願毋輕入。
”承乾納之。
然君集常畏謀洩，忽忽不自安，或中夕驚吒，妻怪之，曰：“公，國大臣，何為爾？