憂患，由此可以想見要成事建功是多麼不容易。
我認為，當今政治，對于那些前代未解決的問題，要激勵而振起。
對于高于前代的東西，更要特别加以愛護和扶持。
”
呂祖謙升著作郎後，因病請辭歸。
這之前，書肆有書曰《聖宋文海》，孝宗命臨安府将此書校正後刊行。
但學士周必大認為該書取舍不當，錯誤較多，恐難傳世，請委館職重新铨釋，以成一代之書。
孝宗因而命呂祖謙負責這項工作。
呂祖謙将此書斷自中興以前，崇雅黜浮，分門别類編為一百五十卷。
書呈皇帝後，被賜名為《皇朝文鑒》。
呂祖謙受诏升直秘書閣。
當時很重職名，不是有功之人不能升任，所以中書舍人陳揆不同意起草诏書。
孝宗批旨說“：館閣之職，文史為先，祖謙所進之書，取舍精當，有益治道，因此特受朕之器重，應當馬上起草任命诏書。
”陳揆不得已照辦。
不久，呂祖謙主管沖佑觀。
又過一年，升為著作郎兼國史院編修官。
去世，終年四十五歲。
谥号“成”。
呂祖謙承繼張載、二程之學，但能旁征博引。
平生心平氣和，不标新立異，一時間，許多傑出人士皆對其心悅誠服。
小時候，性情較為急躁，有一天，當談到孔子言“躬自厚而薄責于人”時，忽然覺得平時那種急躁之情渙然冰釋了。
朱熹為此曾說：“如果能像呂祖謙那樣學習，就能改變自己的氣質之性。
”呂祖謙主張學以緻用，反對空談性理，患病後，其任重道遠之意不衰。
其居家之政，可成為後世楷模。
他修《讀詩記》、《大事記》，皆未成書。
但他考定《古周易》、《書說》、《阃範》、《官箴》、《辨志錄》、《歐陽公本末》，皆行于世。
呂祖謙晚年會友之地曰“麗澤書院”，在金華城中。
去世後，郡人于此為他建了祠堂。
呂祖謙有子名延年。