吳昌裔，字季永，中江人。
小的時候就失去父親，他和哥哥吳泳下決心自立，不肯追逐當時的學術風氣，得到程頤、張載、朱熹的書，就不知疲倦地研究。
嘉定七年(1214)吳昌裔被推舉參加進士考試，聽說漢陽守臣黃幹得到朱熹的傳授，就去跟他學習。
吳昌裔調任為閩中尉。
利路轉運使曹彥約聽說他賢德，就讓他管理買糧的事。
當時發生饑荒，決定到長江上遊去買糧，吳昌裔請求先用本倉所儲的數萬石糧食赈濟災民，然後再慢慢地買糧補上缺額，被采納。
吳昌裔調任眉州教授。
眉州的士大夫原來崇尚蘇轼的學說，吳昌裔拿來各種經典給他們講解，祭祀周敦頤及程颢、程頤、張載、朱熹，公布《白鹿洞學規》，效仿潭州對他們祭奠的禮儀，确定祭祀的器物，士風大大地改變了。
制置使崔與之向朝廷推薦他，他改為華陽縣知縣。
在華陽縣他修建學校，招徕各地的讀書人，廢除羨錢二十萬缗，買良田防備旱災。
吳昌裔擔任眉州通判，寫了《苦言》十篇，考慮蜀地的事十分全面。
他主管眉州政事，用法紀治理軍隊。
不久他為權漢州，按慣例相當于知州，領知州的俸祿，吳昌裔命令削去一半俸祿。
吳昌裔核實兵籍，興辦社倉，漢州的政事頗有起色。
興元統帥趙彥呐決定東面接納武仙投降，西面連結秦、鞏二州，人們不敢反對，吳昌裔獨自奮筆疾書，極力争辯，認為趙彥呐的決定不對。
不久，武仙失敗，秦、鞏二州的人也反叛。
端平元年(1234)，吳昌裔入朝擔任軍器監簿，改為将作監簿，他又改任太常少卿。
徐僑很少肯定别人，隻認為吳昌裔賢德。
吳昌裔兼皇後宅教授，他以祖宗時規定，不用擔當實際職務的官員充當皇後宅教授為理由，極力推辭，朝廷就改任他為吳、益王府教授。
百官輪次奏對時，他首先陳述六件事，它們的條目是“：天理的發揚沒有純大，天德的運行沒有健旺，天命沒有得到修正，天工沒有得到輔助，天職沒有得到治理，天讨還不公平。
”凡是君臣的關系，兄弟的次序，天下人認為最大忌諱而不敢說的，吳昌裔都全面地加以陳述。
至于邊疆的守臣玩弄法令，提升和懲罰沒有章法，吳昌裔講的特别懇切。
吳昌裔被任命為監察禦史，他彈劾時沒有什麼回避，并且說“：現在朝廷的法度紀律果然沒被什麼所擾亂嗎？彈劾到親戚故舊時就把劾