提督時，被他吩咐左右綁起來，差點推出去直接砍頭。
（《明末紀事本末》）
值得玩味的是，同在遼陽的宋應昌當時正在生病，他把朝鮮使者召到病榻前，咬耳朵道：“沈惟敬幹的那點事，是石尚書的主意，我是一點不知道。
之前在廣甯的時候我就跟他說過，若是日本人肯退還全部領土，和談好說，隻要有一寸土地未複，就不該讓步。
他回來以後，居然說願意跟日本人劃大同江而治，我一聽就很生氣，把他直接扣下了。
”（《宣祖實錄》二十五年十二月十二、十三、十七日）
在随後發給朝鮮的一封咨文裡，宋應昌公然說：如遊擊沈惟敬前至倭中揚言，‘将平壤與天朝，不與朝鮮’等語……斷無此理”（《宣祖實錄》二十五年十二月十七）徹底坐實了沈惟敬的罪名。
幾乎就在一瞬間，沈惟敬就淪為了人人喊打的階下囚，從一個英勇的談判代表變成了傷害中朝人民感情的大奸賊。
明眼人都看得出，這些高級官員們的集體變臉隻意味着一件事：
卸磨殺驢。
與日本人談判，終究是一件不光彩的事情。
現在拖延時間的目的已經達到，那麼關于和談本身，變成了一個敏感的禁忌話題。
如果這段交往被人翻出來，就算幾個知情人說得清楚，也要惹上一身腥膻。
尤其是朝鮮人三番五次地在遼東鬧騰，反複問這些官員和談的問題，難保哪句不對傳到禦史的耳朵裡，作為秋後算賬的證據。
大明絕對不會承認自己曾經有過談判的意圖，那麼和談需要被解釋成是一種個人的違法行為，因此找出一個替罪羊來給朝鮮盟友交代，就顯得順理成章。
大明朝的官員們都是抱團的，擅自處理一個忠心耿耿的官員，會讓整個官僚階層寒心。
不過處理沈惟敬，就完全沒有這種壓力，一個市井無賴而已，是士大夫最鄙視的那種垃圾，死就死吧，一點也不可惜。
于是，沈惟敬與小西行長劃大同江而治的約定，便從緩兵之計變成了一個現成的罪名。
石星從一開始找到沈惟敬，就抱定了這種打算，在必要時抛出這枚毫無身份的棄子，讓他承擔一切罪責。
沈惟敬雖然是個大騙子，但他沒有估到政治家們的冷酷和絕情。
在許多關于壬辰戰争的論著裡，研究者們認為沈惟敬在這一時期的議和活動，是大明朝廷主和派的表現，随着李如松入朝日期的臨近，這種議和變得毫無必要，因此才夭折。
事實上，沈惟敬的和談行動從一開始便是為了拖延時間，他從未偏離過這個目标，而且大明官員也都心知肚明。
幸虧朝鮮人自己心裡不踏實，一次又一次地去遼東詢問，并把過程詳細地記錄在《李朝實錄》裡，這才讓後世之人清楚地看到，一個談判家是如何從英雄變成聲名狼藉的漢奸。
沈惟敬本人的遭遇，比他的名聲跌落得更慘。
他從平壤返回遼東以後，按照規矩去求見李如松。
李如松為了壯軍心，表明自己抗戰到底的立場，故意排開了大陣，把所有的幕僚都叫了過來。
沈惟敬上前把自己在平壤的經曆說了一遍，李如松作勢大怒，拍着桌子大罵他是個奸細、叛徒，喝令麾下士兵把他綁縛起來，推出去祭旗。
就在這生死存亡之際，一個人大喊：“刀下留人！”李如松回頭一看，發現喊的人是他的幕僚李應試。
李應試是利瑪窦的親傳弟子，正宗的天主教徒，此時正在李如松帳下當謀主。
李如松有點納悶，李應試跟沈惟敬并無交情，怎麼會替他說話呢？李應試微微一笑，對李如松拊耳說了一句話：“籍惟敬绐倭封而陰襲之，奇計也”。
沈惟敬跟小西行長約定過，李如松會在萬曆二十一年正月前往平壤冊封。
李應試認為這是個好機會，可以讓明軍假裝冒充冊封隊伍，趁日軍失去警惕時賺開城門，平壤可一鼓而下。
李如松一聽，捋髯贊同，命令暫時不要殺死沈惟敬，把他關到囚車裡，随大軍一起出發渡遼。
相信沈惟敬此時的心中，一定充滿了劫後餘生的後怕。
在鬼門關轉了一遭以後，沈惟敬徹底覺悟了，他意識到一個殘酷的事實：自己作為一枚棄子，已經沒有任何退路。
他想活命，就必須不停地證明自己還有價值，不能停，停下來就會死。
在此後的一系列和談中，沈惟敬做出了許多常人無法理解的詭異抉擇，表現出許多常理無法解釋的荒唐行為，讓研究者們為之困惑。
所有這些舉動，都可以從這一刻的沈惟敬身上找到答案。
從現在開始，他必須想盡辦法證明自己的存在還有價值，不然他就會死。
沈惟敬這個時候最羨慕的人，大概是那個在海上逍遙自在的程鵬起吧。