代理禦史大夫。
包拯上奏說“：東宮太子的位置空缺已經很久了，天下人都為此感到擔憂，陛下這麼長久地不作出決定，是為什麼呢？”仁宗問他說“：你認為立誰為好呢？”包拯回答道“：臣下無能，還沒有考慮，我請求早立太子，是為宗廟萬世之大計着想的。
陛下問我想立誰，這是懷疑我。
我已是七十歲的人了，又沒有兒子，并不是為自己和後代邀寵考慮的啊！”仁宗聽了大為高興，說：“這件事還要慢慢商議。
”請求裁減内侍，減少不必要的費用，按條文督促各路監司盡忠職守，禦史府可以自己舉薦所屬官員，減少官吏一年的休假日期，這些建議都得以施行。
張方平做三司使時，因為買土豪的财産，包拯上章彈劾，使他罷了官；宋祁接替了張方平，包拯又彈劾他；宋祁被免後，就由包拯以樞密直學士暫代三司使。
對此歐陽修說“：包拯是所謂牽牛踩踏了田而奪了人家的牛，處罰已經很重了，可他又貪圖肥缺來做那個職務，不也是過分了嗎？”包拯因此待在家裡，以躲避代理三司的命令，過了很久才出來任職。
他主持三司期間改變了過去的一些做法，以前，凡是各種封藏于倉庫供皇帝用的物品，都從各地科派，造成百姓困難。
包拯特此設立市場，公私實行公平買賣，此後百姓不再受到侵憂。
原來司裡吏員欠下金錢布匹，大多受到監禁，其中有些人往往逃走，就連帶拘禁了他們的妻子兒女，像這一類情形的包拯都釋放了他們。
升遷為給事中，為三司使。
幾天以後，拜樞密副使。
不久，調任禮部侍郎，他推辭不受，旋即因患病逝世，終年六十四歲。
死後封贈禮部尚書，谥号孝肅。
包拯性格嚴峻正直，他厭惡官吏做事苛刻，為人敦厚，雖然十分痛恨壞人，但未嘗不推重以忠恕待人。
他不輕易與人相交，不會用僞裝的甜言笑臉來讨别人喜歡，平時沒有私人請托的書信，舊友、親戚同鄉都斷絕往來。
地位雖然顯貴，可是衣服、器用、飲食同當平民時一樣。
他經常囑咐說“：我的後代子孫做了官，若有犯貪污罪的，就不得回老家，死了不許葬在祖墳中。
不順從我的心意，就不是我的子孫。
”早先，包拯有一個兒子名叫纟意，娶崔氏為妻，任潭州通判，已死。
其妻崔氏一直守節，至死都沒有再嫁人。
包拯曾經逐走一位偏房，這位小妾在自己父母家生了一個兒子，崔氏暗地裡照顧她們母子，派人精心地看護她們。
纟意死後，崔氏就接回了這位小妾的兒子，取名為纟延。
包拯共有奏章十五卷。