正德四年(1509)正月十三日，大祭天地于京城南郊。
二月二十四日，削除劉健、謝遷官籍。
三月十二日，赈濟浙江饑荒。
十七日，吏部侍郎張纟采請求不定期考察在京官員，武宗采納了他的建議。
四月十四日，王鏊退休。
六月二十八日，吏部尚書劉宇兼文淵閣大學士，參與機要事務。
八月一日，遣使核實天下各邊境屯田。
這月，義州發生兵變。
閏九月，小王子侵犯延綏，包圍總兵官吳江所在地———隴州城。
十一月六日，侵犯花馬池，總制尚書才寬戰死。
十二月二十三日，削奪劉健、謝遷等六百七十五人授官诰命。
這年，兩廣、江西、湖廣、陝西、四川盜賊并起。
琉球、安南、哈密、土魯番、撒馬兒罕來朝進貢。
正德五年(1510)正月十日，在京城南郊大祭天地。
二十三日，查抄原尚書秦..家。
二月七日，兵部尚書曹元為吏部尚書兼文淵閣大學士，參與機要事務。
三月十六日，祈禱下雨，釋放囚犯，免正德三年欠交賦稅。
三十日，江西賊猖獗，右都禦史王哲巡視南、贛二州，刑部尚書洪鐘總督節制四川、陝西、河南、鄖陽軍務，兼赈恤湖廣。
四月五日，安化王蜫钅番反叛，殺巡撫都禦史安惟學、總兵官姜漢。
二十一日，起用右都禦史楊一清總制甯夏、延綏及甘、涼二州軍務，泾陽伯神英充任總兵官，征讨蜫钅番。
二十六日，下诏大赦天下。
太監張永總督甯夏軍務。
這天，遊擊将軍仇钺襲擊并擒捉蜫钅番，平定甯夏。
五月二十九日，焦芳辭官退職。
六月十六日，武宗自稱大慶法王，有關部門鑄造印進獻給他。
二十二日，劉宇停職。
七月十八日，洪鐘征讨沔陽盜賊，平定沔陽。
八月十一日，劉瑾因謀反被下獄。
下诏從正德二年以後所更改的政策法令全部按原來的執行。
十五日，懲治劉瑾同夥。
吏部尚書張彩下獄。
十六日，曹元停職。
二十四日，革除甯王護衛。
二十五日，劉瑾被誅滅。
二十六日，釋放貶官戍邊諸位大臣。
九月三日，讨論平定蜫钅番功勞，封仇钺鹹甯伯。
五日，吏部尚書劉忠、梁儲并兼文淵閣大學士，參與機要事務。
六日，因平定蜫钅番、劉瑾有功，封太監張永兄長張富、弟張容皆為伯。
十九日，封義子指揮同知朱德、太監谷大用兄谷大寬、馬永成兄馬山、魏彬弟魏英皆為伯。
十月十六日，殺張彩丢屍棄市示衆。
十二月七日，盜賊攻陷江津，佥事吳景戰死。
當年，日本、占城、哈密、撒馬兒罕、土魯番、烏斯藏入朝進貢。
正德六年(1511)正月十三日，大祭天地于京城南郊。
二十二日，盜賊攻陷營山，殺佥事王源。
二月十五日，蜫钅番伏誅。
二十八日，起用左都禦史陳金總督節制江西軍務征讨盜賊。
三月十八日，賜楊慎等進士及第，出身各有差别。
二十日，惠安伯張偉充任總兵官，右都禦史馬中錫提督軍務，征讨直隸、河南、山東盜賊。
二十六日，減免遭兵禍州縣稅糧一年。
當月，小王子侵入河套，侵犯沿邊各堡。
四月四日，劉忠乞求省視祖墓返回。
這月，淮安盜賊興起。
六月，山西盜賊興起。
七月二十四日，盜賊侵犯文安，京師戒嚴。
二十五日，征調宣府、延綏兵進入京師救援。
八月二日，兵部侍郎陸完率領邊境軍隊征讨盜賊。
四川巡撫都禦史林俊擒殺賊首領藍廷瑞、鄢本恕。
七日，盜賊劉六侵犯固安。
九日，召張偉、馬中錫回京。
九月十九日，再次調集宣府及遼東兵增援陸完軍隊。
十月六日，盜賊攻陷長山，典史李暹戰死。
七日，盜賊在濟甯州焚燒糧食船隻。
二十日，甘肅副總兵白琮在柴溝打敗小王子。
十一月四日，太監谷大用、張忠、伏羌伯毛銳率領京師軍隊與陸完一起征讨盜賊。
十日，戶部侍郎叢蘭、王瓊赈濟兩畿、河南、山東。
十二日，京師地震。
十五日，命令修身反省。
二十九日，掩埋外露屍骨。
十二月十七日，禮部尚書費宏兼文淵閣大學士，參與機要事務。
十八日，清河到柳鋪一段，