後，幾次召他，向他詢問政事。
第二年春天，孚敬又回到内閣中來，事事都一個人做主，李時也不敢有什麼評論。
沒多久，方獻夫也進來了，與李時也能合得來。
彗星又一次出現，世宗召見李時等人，教導他們要引咎、修身、反省，又随便說到人才缺少。
李時回來後上書講了實現安定局面、愛惜人才和慎重刑罰三件事，很有些話提到了因為“大禮”之争而吃官司被罷黜的大臣們。
世宗以贊揚的口吻做了批複，但最終還是沒有采用他的意見。
給事中魏良弼、禦史馮恩先後彈劾吏部尚書汪钅宏，觸怒了世宗，李時都替他們上書解救。
十二年(1533)，孚敬又一次返回到内閣裡來，翟銮回家守喪去了，獻夫退休了。
李時跟随在孚敬後邊，隻能是拱手說“好好”就是了，因此孚敬還容得下他。
孚敬退休後，費宏又一次入閣，不久就死了，李時于是獨自一個做輔臣。
他平時對人就寬厚、和易，到現在越發以清靜主持大局。
世宗也經常傳他到便殿裡談話，親切地向他咨詢政事。
李時雖然沒有什麼大的補救，但是議論總是以忠厚為根本，朝中大臣也都認為他是個好人。
客星在天蒬旁出現，世宗問會發生什麼事，他回答說：“事應的說法起自漢朝的京房，未必都與事實相符。
全靠皇上修養自己的品德來消除為宜。
”世宗聽後予以稱贊。
後來他陪同世宗去晉見皇陵，經過沙河時，世宗看到附近村莊破爛不堪，居民很少，神色暗淡地說“：七座皇陵在這裡，應該加以守護。
”李時回答說：“過去丘..曾建議，京城應該設立四處屏障，以臨清為南屏，昌平為北屏，薊州、保定為東、西屏，各駐兵一二萬。
現在如果在昌平增設一個總兵官，往南可以保衛京城，往北可以守護皇陵。
”世宗于是下發大臣們讨論，決定在沙河修築鞏華城，置兵防守。
李時前後被加官為少傅、太子太師、吏部尚書、華蓋殿大學士。
當時夏言入閣，李時不與他對抗，事事都推讓給夏言做主，夏言也能容得下他。
世宗對待李時不如孚敬、夏言那麼寵信，然而也很少指責、欺辱他，對他的信任始終沒有減少，這是孚敬、夏言也無法相比的。
嘉靖十七年十二月，李時還在位時死掉了，贈太傅，谥文康。