期間，明朝最為富庶，張學顔頗有貢獻。
然而此時後宮的開支繁多，經常索取。
張學顔就事勸谏，得以停發了十萬兩太倉銀，減少了雲南一千兩黃金的課稅，其餘的大都無法堅持自己的意見了。
但是每年增加二十萬兩金花銀，就成了定額。
人們也因此而對他有看法。
萬曆十一年(1583)四月他改任兵部尚書，當時剛興起宮中練兵，挑選了二千多名宮中小臣和奴仆集中訓練，撥發三千匹太仆寺的馬給他們。
張學顔堅持不給馬匹，又奏請停止宮中練兵，神宗都不聽。
當年秋天，皇帝的禦車由山陵返回，張學顔上奏說：“皇上恭奉聖母，駕車前往，在陵園拜祭，占蔔壽命，六軍的十多萬将士，全部一齊肅立。
隻有宮中練兵的随從軍士，舉止放縱。
起初到達涼水河，喧嘩争吵毫無紀律，奔跑沖撞，使天顔變色。
現在禦車已經返回，隊伍仍未解散。
謹稽查舊制，營軍随禦駕到郊外祭祀，開始由内庫提供裝備，事情完了就歸還。
宮中隻有随從的内侍首領允許佩戴弓矢。
又有律法：不是素來護衛的軍士，手持片刃進入宮殿門，絞殺；進入皇城門，發配戍邊。
祖宗防範弭亂的考慮很深遠。
現在皇城内身披铠甲乘馬持利刃的人，科道不能糾察，兵部不能檢查。
又召集小厮、仆隸，出入禁宮，萬一驟然産生邪念，結黨謀亂，在宮内嘩變但宮外的臣子不敢入内，在夜晚嘩變則宮外的兵丁不知道，在都城白天嘩變則稱天子的親兵，驅逐也不肯離散，追捕他們又不敢觸犯。
正德年間，西城練兵的事，可以很好地借鑒。
”奏疏呈上，宦官都切齒痛恨，就制造流言蜚語地加以中傷。
神宗覺察後，也追查這篇上書的主使人。
張學顔得以幸免，然而他的意見也不被接受。
考績期滿，加封為太子少保。
雲南的嶽鳳、罕虔被平定，他升任太子太保。
當時張居正已死，朝廷的議論很不相同。
起初，禦史劉台因為彈劾張居正被治罪，張學顔又抨擊他貪污。
禦史馮景隆抨擊李成梁粉飾功績，張學顔趕緊稱李成梁的十次勝利不是虛妄的事，馮景隆被貶職。
張學顔以前受張居正厚愛，與李成梁共事很久，衆議都認為張學顔與張居正、李成梁結黨。
禦史孫繼先、曾乾亨，給事中黃道瞻接連上奏抨擊張學顔。
張學顔上書辯解請求離職，又奏請留用黃道瞻，皇帝不聽，第二年，順天府通判周弘袍又抨擊張學顔與太監張鲸勾結，神宗将他們都罷黜且逐出京城。
張學顔八次上奏請求退休，皇帝允許他辭官離去。
萬曆二十六年(1598)死于家中，封贈為少保。