帝稱他們為父母。
唐代的田令孜，僖宗也稱他為阿父，明代的王振、曹吉祥、劉瑾，皇上寵愛他們的程度甚過了群臣。
他們中有一個在窗下老死、保全了富貴嗎？現在陛下授予魏忠賢無上的職權，不是為國家考慮，也不是為魏忠賢着想。
如果不是宰相元老，九列巨卿，怎麼可以自己處于商辂、劉健、韓文之下呢？”奏疏呈上，皇上責備他亵渎。
崔呈秀因貪贓被彈劾，鄒維琏認為應讓他戍邊。
那些讨好魏忠賢的人極力為崔呈秀申辯、求情，鄒維琏一概不聽，這些人特别恨他。
等到趙南星離職，鄒維琏願與他一起走，魏忠賢立即同意。
沒有多久，張讷彈劾趙南星，認為鄒維琏調到吏部是不合法的，皇上下诏将他的名籍除掉。
又卷入汪文言一事，被審問，派去戍守貴州。
崇祯初年，起用為南京通政參議，接着升任太仆少卿，上疏陳明閣臣選擇、官員久任、接納谏言、議論号谥、運籌兵事等五件事。
崇祯五年(1632)二月提右佥都禦史，代替熊文燦巡撫福建。
海盜劉香叛亂，派遣遊擊鄭芝龍擊破他。
荷蘭人占據澎湖，要挾互市，後又移往台灣，逐漸停泊在廈門。
鄒維琏屢次命令鄭芝龍防備，鄭芝龍總是不聽。
第二年夏天，鄭芝龍在福甯剿滅盜賊，荷蘭人乘機偷襲占領廈門城，大肆搶掠。
鄒維琏急忙發兵水陸并進，鄭芝龍也馳援，燒毀了荷蘭人三條船，官軍傷亡也不少。
盜寇于是乘舟出洋，轉而在青港、荊嶼、石灣搶掠。
諸将在銅山守禦，連續戰鬥數日，盜寇才敗走。
鄒維琏在福建二年時間中，成績甚為顯著。
恰好當權的溫體仁平素就忌恨鄒維琏，而福建人在京城當官的人也在朝廷诽謗他，鄒維琏竟然被免職。
八年春天，陳叙打退盜賊的功勞，皇上下诏起用他。
不久，拜為兵部右侍郎，正好患病沒有赴任，在家死去。