曾經上書推薦趙南星，彈劾馮铨，馮铨極為惱恨。
五年(1625)三月，慎言請假回去後，馮铨囑咐曹欽程上書彈劾他，誣陷他盜取了繁曹縣的三千庫銀，于是朝廷下令撫按官追贓，慎言被編排到肅州充了軍。
莊烈帝即位後赦免了慎言，崇祯元年(1628)起複他官任原職。
當時恰好要考核京官，慎言上書請先懲辦追随閹黨的人的附逆之罪，再把其他人交付考功，莊烈帝批示同意了。
慎言不久升任太仆少卿，又先後做太常卿、刑部右侍郎。
在審理耿如杞一案時沒能讓莊烈帝滿意，慎言和尚書韓繼恩一道被打入監牢，不久他被罷官還鄉去了。
很久以後，朝廷又召他回朝當工部右侍郎。
當時國家财用不足，朝廷讨論要開采金銀，鑄造貨币，開展屯田，改革鹽法等，慎言屢次上書評論，所談到的都是國家的根本大計。
大學士楊嗣昌主張改府州縣佐為練備、練總，慎言認為改革制度一事關系重大，前後奏進八篇論議，後來這一改革終于沒能實施開來。
慎言以後由左侍郎升為南京戶部尚書，他七次稱病辭謝，朝廷都不允許，并就此讓他改任吏部尚書，掌管右都禦史的事務。
十七年(1644)三月，京師失陷。
五月，福王在南京即位，讓慎言辦理吏部事務。
慎言上書講了中興十議，分别是：節制兵鎮，親近藩王，開辟屯田，懲治叛逆，驅除僞官，表彰烈士，論功行賞，起用廢籍，嚴懲貪污，清理漕稅。
福王都高興地采納了。
當時朝廷大力起用廢籍，慎言推薦了吳生生、鄭三俊。
朝廷命令吳生生觐見，三俊不許，這道命令是由大學士高弘圖起草的。
勳臣劉孔昭、趙之龍等人一天在罷朝以後在朝堂上聚衆吵鬧，把慎言和吳生生指斥為奸邪，他們喊叫的聲音響徹殿堂。
給事中羅萬象說“：慎言平生