江倉的紅印。
楊巨源、李好義擔心事情洩露，就在開禧三年二月二十九日，天沒亮時，李好義率他的部下沖入僞宮，楊巨源拿着诏書、騎着馬，自稱是朝廷使臣，進入吳曦的寝室，吳曦開門想逃，李貴抓住并殺死了他。
吳曦的衛兵開始還抵抗，聽說有诏書就都退去。
楊巨源、李好義迎接安丙宣讀诏書，用吳曦的頭示衆。
三軍推舉安丙權四川宣撫使，楊巨源權參贊軍事。
安丙向朝廷奏功，把楊巨源排在第一，皇上下诏楊巨源補為承事郎。
楊巨源對安丙說：“吳曦死了，賊膽已破，關外四州是蜀的要害，應該乘勢收複。
”李好義也這麼說。
安丙擔心軍中沒有現成的糧草，楊巨源極力講不奪取四州，必有後患，自己請求為随軍措置糧運。
于是安丙分别派李好義收複西和州，張林、李簡收複成州，劉昌國收複階州，孫忠銳收複大散關。
不久诏命楊巨源升為朝奉郎，差遣為通判，兼任四川宣撫使司參議官。
安丙一向讨厭孫忠銳，聽說孫忠銳在大散關失守，傳檄召他回來，想廢掉他，安丙先命令楊巨源同朱邦甯一起率兩千人去策應。
楊巨源到鳳州，趁孫忠銳出來迎接之機，在帳幕後埋伏壯士，突然出來殺了孫忠銳和他的兒子孫揆。
安丙就以孫忠銳附會吳曦，進獻賀表為罪名上告給朝廷，并且自己等待處治。
先前，獎谕誅叛賊的诏書到達沔州，楊巨源對人說“：诏命中沒一個字提及楊巨源，懷疑有掩蓋我功勞的人。
”不久傳來授予王喜節度使的消息，楊巨源更加不平。
這時趙彥呐因在夔州殺死祿禧而得到州通判的官職，楊巨源說：“殺祿禧給通判的官職，殺吳曦也給通判嗎？”楊巨源用書函感謝安丙說“：魯仲連寫信勸燕将撤守，幫助齊國收複了聊城，不受齊王的封爵，我十分敬慕他的高尚行為；陶淵明不為五鬥米折腰，棄去彭澤令的官印而歸隐，成就他的清風亮節。
”他又派人到朝廷訴說自己的功勞，又慫恿興元都統彭辂給韓..胄寫信，彭辂明裡答應，暗中報告了安丙。
有人說楊巨源和他的部下米福、車彥威謀劃作亂，安丙命令王喜審訊他們，米福、車彥威都獲罪。
正将陳安又告發楊巨源集結敢死士入關，想燒沔州州治，等安丙出來就殺了他。
安丙綜合以前的事，就想除去楊巨源，但沒什麼确鑿的證據。
恰好楊巨源在鳳州給金國鳳翔都統使送去檄書，其中的話像是用了間諜，并自稱是宣撫副使而用參議官的印蓋