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入朝應對，陳述六件事，說“：清除淺陋的以起事功，昭示勸懲的以收權柄，清查班著以儲備真才實學，重視藩輔以保護都邑，使用閩、越之地的水軍以屏防海上，集合東南的全部力量來防守長江。
”理宗皇帝對這些都予以贊揚、采納。
改任樞密院編修官，暫任右司，籌畫樞密院西府、中書門下東府二府事宜，通而守法。
恰逢右史方大琮、編修劉克莊、正字王邁因為上書言事而被貶黜，徐鹿卿以詩相贈，奏事的人一起彈劾他們，太學的學生們做《四賢詩》。
擔任建昌軍知軍，未上任，而崇教、龍會兩保與建黎原、鐵城的民衆因積怨而兵刃相見，徐鹿卿急馳書布告他們，斂手聽命。
任職後，即寬賦薄斂，禁止掊克，裁汰贓濫，抑制豪強，撫恤寡孤弱小，懲罰貪官污吏，訓練士卒，創建百丈寨，選練将帥、士卒，修築城邑牆垣，治縣行為大為人們信服，鄉裡田野都歌頌他的政績。
督府橫取秋苗斛面，建昌有上交五千斛的任務。
徐鹿卿為此相争說“：我郡守職務可以免去，但是米得不到。
”民衆都擔心失去徐鹿卿，請求輸送米以共命運。
徐鹿卿說：“民衆為我打算是好的，難道我就不為民衆打算嗎？”最後以抗争而免除了五千斛米的負擔。
召他赴朝，打算出發去京，南豐發生盜亂，他捕斬渠首二十人，其他的人都不問罪。
擢升度支郎官兼任右司。
入對于朝，極陳時弊。
改任侍右郎官兼敕令删修官，兼任右司。
徐鹿卿又說當時宰相并列的弊端。
宰相以甜言蜜語誘引徐鹿卿，徐退下後告訴别人說：“是牢籠，我不能為宰相的黨人。
”議事官以其他的事诋毀徐鹿卿，徐鹿卿主管雲台觀。
過了一個多月，起用為江東轉運判官。
當年大饑，人以人肉為食，留守别之傑諱言不追問，徐鹿卿下令暗中捕拿吃人肉的人，懸屍于市示衆。
又奏援引真德秀為漕官時撥錢用以幫助赈給，沒被向上報告。
于是拿出本官司庫米三千多石按半價出售，及減抵當作庫息，又拿出缗錢一萬七千赈送饑民，勸居民收養孤兒，每日給錢米，因此而活的孤兒有幾百人。
宴飲或與人集聚時不用