惟說的緣故嗎？馮惟說即将有新的任命了。
”徐鹿卿于是才出來任職。
升任太府少卿兼右司。
入朝應對，奏請穩定國本，端正紀綱，定立規模，“時事多艱，人心易搖，既沒有獨立承擔重任的大臣，又沒有守節伏義的儒士，希望早決定大計”。
理宗皇上贊揚了他的議論，兼任中書門下省檢正諸房公事，兼任崇政殿說書。
一年以後，暫兼任吏部侍郎。
當時人們議論要求執政分别治理兵事與财政，徐鹿卿堅持認為不行。
因為疾病而請求擔任祠官，遷右文殿修撰、知平江府兼發運副使。
執意請求祠職，理宗皇帝诏谕丞相挽留他。
召他暫任兵部侍郎，力求辭任，皇上诏令丞相以書信招他入朝，徐鹿卿到後，又極言君子小人，切于當世的時務。
兼任國子祭酒，暫任禮部侍郎，兼同修國史，兼實錄院同修撰，兼侍講，兼理權給事中。
徐鹿卿說“：瑣闼細小的官吏沒有什麼不應當過問的，近年，朝廷命令已下而給舍等官員不得而知，請求恢複舊制。
”诏令按奏請的做。
理宗皇上對他誠懇地關心，以緻漸漸引起越來越多的人妒忌，有的撰拟假的奏疏托請徐鹿卿給以傳遞，屢次诋毀宰相以及各種大小官員，徐鹿卿開始不知道，後來就在皇上面前洗刷自己，請求罷去官職，理宗皇上對他說：“你離職而去，正好中了奸人的計謀。
”诏令臨安府根絕捕拿造假疏的人，因事件與一些有勢力的要人有牽連，獄事沒有依法追查到底。
遷升禮部侍郎後，徐鹿卿多次上疏辭職告老還鄉，授任寶章閣待制，擔任甯國府知府，而以年齡大了要求告老的奏疏上了五次，沒有被批準，提舉鴻禧觀，于是緻仕，進升華文閣待制。
死時，遺表送聞，贈賜四官。
徐鹿卿居家忠孝友睦，喜怒不表露于形，恩怨都能泯滅不言，宗族親屬，鄉裡黨人，都得歡喜之心。
擔任官職廉潔、簡約、清正、嚴峻，不随便拿取一點點東西，一棟草廬剛能遮擋風雨。
所寫的著作有《泉谷文集》、奏議、講義、《鹽楮議政稿》、《曆官對越集》，手編《漢唐文類》、《文苑菁華》，谥号“清正”。