州，轉為杭州知州。
章惇入朝任翰林學士。
元豐三年(1080)，章惇被任命為參知政事。
朱服為禦史，章惇暗中派門客同朱服溝通，被朱服告發。
章惇的父親強占百姓沈立的土地，沈立攔住章惇并向他訴說，被章惇抓到開封。
章惇因以上二件事獲罪，被貶為蔡州知州，又曆任陳、定二州知州。
元豐五年，章惇被召入朝任門下侍郎。
豐稷上奏說“：官府剛開始刷新就首先任用章惇，這不是研習古事、設置官府的意思。
”豐稷獲罪降職。
谏官趙彥若又奏論章惇沒有德行，皇上沒答複。
哲宗即位，章惇為知樞密院事。
宣仁後掌政，章惇和蔡确詐稱有定策功。
蔡确被罷，章惇不安，就駁斥司馬光所改的役法，達數千言。
大略說：“保甲、保馬法一日不罷去，有一日的危害。
役法在熙甯初年就改為免役，後來才有弊端；現在又恢複為差役，應該全面讨論，然後施行，不該馬上改變，留下後悔。
”呂公著說“：章惇說的固然有可取之處，但他專在求勝，不顧朝廷大體。
”司馬光的建議施行後，章惇憤恨地在太後面前争辯，他的話十分不恭敬。
宣仁後大怒，劉摯、蘇轍、王觌、朱光庭、王岩叟、孫升接連攻擊他，他被貶出朝任汝州知州。
在七八年内，他多次被言官彈劾。
哲宗親政後，有恢複熙甯、元豐時各法的意圖，首先任用章惇為尚書左仆射兼門下侍郎，于是章惇專以“紹述”為國事，凡是元惇所改的全都恢複。
引用蔡卞、林希、黃履、來之邵、張商英、周秩、翟思、上官均居要職、任言官，他們朋比奸邪、報複仇怨，大小官僚，無一幸免，死去的殃及妻、子。
甚至诋毀宣仁後，說元惇初年是老奸擅國。
又請求掘司馬光、呂公著的墳，砍他們的棺材。
哲宗沒答應，章惇不滿，請求編輯、分類元惇時大臣們的章疏，有見識的人知道禍患沒消除。
于是就處治劉安世、範祖禹勸谏宮中雇乳母的事，又用文及甫陷害别人的文書引導蔡渭，讓蔡渭告發劉摯、梁焘有反謀，興起同文館案，命令蔡京、安..、