有不盡心盡力的，都願意效死于他。
劉繇棄軍自己逃走，各州郡的太守們也都紛紛棄城逃跑。
吳郡人嚴白虎等各率有一萬多人，駐紮嚴守各自的地盤。
吳景等想先擊破嚴白虎等，然後再到會稽。
孫策說：“嚴白虎等盜賊，心無大志，憑此就将其擒獲。
”于是率兵渡過浙江，占據會稽，屠城東冶後，攻破嚴白虎等盜衆。
孫策将原有長吏全部更換，自己兼任會稽太守，又以吳景為丹楊太守，以孫贲為豫章太守，分豫章另置廬陵郡，以孫贲弟弟孫輔為廬陵太守，丹楊人朱治為吳郡太守。
彭城人張昭、廣陵人張郃、秦松、陳端等為謀士。
此時袁術擅自稱帝，孫策去信譴責并與他絕交。
曹操上表舉薦孫策為讨逆将軍，并封爵吳侯。
後來袁術死後，長史楊弘、大将張勳等想率領部下投靠孫策，廬江太守劉勳半路截擊，并将他們全部俘虜，收繳了他們所帶的珍寶後返還。
孫策聽說後，假意與劉勳結盟為友。
劉勳得到袁術的軍隊，此時豫章上缭的宗民有一萬多戶在江東，孫策勸劉勳前往攻取。
劉勳出兵後，孫策率領部下輕裝奔襲，一夜間即占有廬江，劉勳的軍隊全部投降，劉勳隻帶着幾百個部下投歸曹操。
這時袁紹的勢力正強大起來，而孫策又吞并了江東，曹操已無力東顧，就打算對孫策實行安撫。
于是把弟弟的女兒許配孫策的小弟孫匡，又為兒子曹章娶取孫贲的女兒，用禮征召孫策的弟弟孫權、孫翊，并令揚州刺史嚴象舉薦孫權為秀才。
建安五年(200)，曹操與袁紹在官渡對壘相持，孫策暗中盤算襲擊許昌，迎取漢獻帝，便秘密整頓軍隊、部署将領。
還未行動，他就被過去的吳郡太守許貢的門客所殺害。
起先，孫策殺許貢，許貢的小兒子與門客逃亡隐居在長江邊。
這次孫策單身匹馬外出，猝然與許貢的門客相遇，門客擊傷了他。
孫策傷勢甚重，就請張昭等前來說：“中原正在大亂之中，憑我們吳、越的兵衆，三江的險固，足以觀其虎鬥成敗。
您們要好好幫助我弟！”又招呼孫權，将印绶交予他，對他說：“率領江東兵衆，決戰兩陣之間，橫行争衡天下，你不如我；但舉賢任能，使其各盡其心，用以保守江東，我不如你。
”到夜間孫策便死去，時年二十六歲。
孫權登基稱帝後，追谥孫策為“長沙桓王”，封孫策的兒子孫紹為吳侯，後改封為上虞侯。
孫紹死後，他的兒子孫奉繼承爵位。
孫皓為帝時，謠傳孫奉應為皇帝，于是孫皓将其誅殺。