黃藥師精通五行，當年看了全真教的天罡北鬥陣後，潛心苦思，參以古人陣法，創下這二十八宿陣。
中央黃陵五氣，屬土，由郭靖統軍八千，此軍直搗中央，旨在救出郭襄，不在殲敵。各軍背負土囊，中盛黃土，一攻至台下，立即以土囊滅火壓柴，拆台救人。
南方丹陵三氣，屬火，一燈大師統軍，領軍八千。此路兵中一千人衛護主将，其餘七千人編為七隊，分由朱子柳、武三通、泗水漁隐、武敦儒、武修文兄弟、武敦儒夫人耶律燕、武修文夫人完顔萍等七人統率。上應朱雀七宿，是為井木犴、鬼金羊、柳土獐、星日馬、張月鹿、翼水蛇、轸火蚓七星。
北方玄陵七氣，屬水，由黃蓉統軍，領兵八千。此路兵中一千人護衛主将，其餘七千人編為七隊，分由耶律齊、梁長老、郭芙及丐幫諸長老、諸弟子統率。上應玄武七宿，是為鬥木獬、牛金羊、虛日鼠、危月燕、室火豬、壁水七星。
東方青陵九氣，屬木，此路兵由東邪黃藥師統軍，也是統兵八千。東路兵也分八隊，一路護衛主将，其餘七路上應青龍七宿，是為角木蛟、亢金龍、氐土貉、房月狐、心日兔、尾火虎、箕水豹七星。
西路軍由周伯通領兵八千，其中一千相煩瑛姑統率，衛護主将，其餘七隊由李志常等全真教第三代弟子分領，上應白虎七宿，是為奎木狼、婁金狗、胃土熊、昂日雞、畢月鳥、觜火猴、參水猿七星。
東路軍各人背負一根極長的木樁，攻到高台東首，一千兵手執盾牌，沖前擋箭，其餘七千人紛紛放下木樁，東打一根，西打一根，看來似乎雜亂無章，實則八千根木樁的位置皆依黃藥師所繪圖畫豎立，分按五行八卦，頃刻間已将高台東首封住。
西路軍以全真教為主力，群道素來熟悉天罡北鬥陣法，隻見長劍如雪，七人一堆，四十九人一群，左穿右插，蜂擁卷來，蒙古兵将看得眼也花了，隻得放箭阻擋。
北方衆軍發喊，卻是黃蓉領着丐幫弟子，拖着一架架水龍，将毒汁往蒙古兵身上射去。那毒汁濺身，登時疼痛不堪，少刻便即起泡腐爛，蒙古軍抵擋不住，向南敗退。
南方煙霧沖天，乃是一燈大師率領八千人施行火攻，硫磺硝石之屬一陣陣從噴火鐵筒中噴出。蒙古軍見勢不對，當即敗至中央。
郭靖領軍八千，随後緩緩而上，見蒙古軍亂，當即揮軍而前，直沖高台。
二十八宿大陣暗伏五行生克之理。南路一燈大師的紅旗搶向中央，郭靖的黃旗軍奔西，周伯通的全真教白旗軍沖向北方，黃蓉率領下的黑旗軍趨東，黃藥師的青旗軍轉向南路。
這五行大轉，是謂火生土、土生金、金生水、水生木、木生火。宋兵雖隻4萬人，但陣法精妙，領頭的均是武林好手，是以蒙古人雖然多了一倍，竟也抵擋不住。
激戰良久，黃藥師縱聲長嘯，青旗軍退向中央，黃旗軍回攻北方，黑旗軍迂回南下，紅旗軍疾趨而西，白旗軍東向猛攻。這陣法又是一變，五行逆轉，是謂木克土、土克水、水克火、火克金、金克木。
亂石陣是從諸葛亮的八陣圖中變化出來。當年諸葛亮在長江之濱用石塊布成陣法，東吳大将陸遜入陣後難以得脫。這陣圖的三十六項變化，實是繁複奧妙，即使是像楊過聰明過人，一時也隻記明白十餘變。
二十八宿方位有：“朱雀移青龍，巽位改離位，乙木變癸水。”“角木蛟變亢金龍！”，“心月狐轉房日兔”，“畢月烏移奎木狼”，“女土蝠進室火豬”等。
石梁派溫氏五老這套五行八卦陣，是排成一個圓圈，坐在椅子上，将敵人圍在中間；在五人之外，又有16名好手，又分坐16張矮凳，按八卦方位而坐，圍成一個大圈，八卦乃是作為五行陣的輔佐。敵人入圍之後，不論如何硬闖巧閃，五老必能以厲害招術反擊，一人出手，其他四人立即綿綿而上，不到敵人或死或擒，永無休止。五老招數互為守禦，步法相補空隙。臨敵之際，五人猶似一人。溫家五老見識甚淺，五行陣為先人所創，八卦陣法為五老後創，但若有人能破了五行陣，八卦陣徒然自礙手腳，他們自行增添一個陣勢，反成累贅。
金蛇郎君為了對付溫家五老，在《金蛇秘笈》最後的數頁，創出了破解五行陣之法，那就是“後發制人”四字。袁承志當初見這套武功搞得相當繁複，有許多招數顯然頗有蛇足之嫌，心想和人接戰之際，敵人武功再高，人數再多，也決不能從四面八方同時進攻，不露絲毫空隙，而這套武功明明是為了應付多方同時進攻而創。
袁承志與石梁派溫氏五老發生沖突時，袁承志身處五行八卦陣，方醒悟金蛇郎君當日創出這套武功來，卻是專為破這五行八卦陣而用。《金蛇秘笈》最後摧敵緻勝的那一路“快刀斬亂麻”，數十招都是要靠寶刀寶劍來使敵人不敢欺近，方能乘機打亂敵陣。破陣之道，在于設法擾亂五人的腳步方位，隻需引得五個老頭兒中有一人走錯腳步，或是慢得一慢，這陣就破了。