他想得很好。
但是，偷襲珍珠港實施起來難度不小，損失可能很大。
所以，即便山本此時已晉升為海軍大将，這事仍不能擅自做主。
山本手下的兩個艦隊司令南雲忠一和冢原二四三，一緻反對偷襲計劃，還派出參謀面陳反對意見，但派去的參謀反而被山本說服。
不過，光說服參謀不行，東京大本營仍然反對，最終山本以辭職相威脅，甚至通過好友高松宮親王（天皇的弟弟），将計劃直接呈送給天皇，終于在1941年10月19日獲得批準。
迷惑美國人
偷襲珍珠港計劃獲得批準之時，距實施時間隻有50天。當然，山本五十六抱着勢在必行的決心，早就開始準備了。
偷襲計劃将所有細節都考慮得非常周密。
在兵力編排上，既要求具備強大的突擊能力，又要求避免編隊過于龐大而被發現。
山本親自挑選并任命了海軍航空兵中具有3000小時飛行經驗的淵田美津雄中佐擔任訓練總教官，并讓他親自帶隊實施攻擊。
針對珍珠港水深隻有10～12米的特點，艦載魚雷機進行了多次模拟實戰，直到飛行員們确保魚雷機在20米高度，投雷命中率達到60%才罷休。
為了迷惑美國人，日本重啟了對美談判。
1941年2月，日本政府任命退役海軍大将、羅斯福總統的好友、著名親英美人士野村吉三郎為駐美大使。
幾個月中，他與美國官員會談多達數十次。
7月，近衛文麿首相緻信羅斯福，表示兩國之間什麼問題都可以談，保證絕不侵犯美英在東南亞的利益。
10月18日，東條英機取代近衛，接任首相。
11月5日，禦前會議決定對美英開戰。
就在同一天，日本還派出曾任駐美領事、娶了美國老婆的親美派來栖三郎為和平特使，赴美談判。
箭已在弦上
11月26日淩晨6時，突擊編隊主力從單冠灣起航。山本這個時候還對突擊編隊主力發出指示，如果對美談判獲得成功，就要立即返航。
這充分體現了山本的矛盾心情。
其實，他心裡也清楚，雙方的要價離得太遠，談判根本不可能成功。
前戲演得差不多了，箭已在弦上，該放就放吧！12月6日，山本仿效他崇拜的東鄉平八郎向攻擊編隊指揮官南雲忠一發出動員令：“皇國興衰在此一戰，我軍将士務必全力奮戰！”南雲的旗艦“赤城”号升起了“Z”字旗。