6月5日淩晨，日本聯合艦隊司令長官山本五十六大将否決了其首席參謀黑島大佐提出的集中全部艦隻在白天轟炸并登陸中途島的挽回敗局方案，下令：“取消中途島的占領行動。
”并表示“所有責任由我一個人來擔當，我回去向天皇陛下請罪”，他把自己關進會客室，一連三天拒絕會見部下。
6月5日夜間，日軍兩艘重巡洋艦“最上”号和“三隈”号在濃霧中轉向時互撞，“最上”号受重創。
随後美軍發現了這兩艘巡洋艦。
6月6日天亮，美軍飛機一波又一波地轟炸“三隈”号和“最上”号。
“三隈”号葬身海底，而被撞傷的“最上”号反而逃過一劫，掙紮着返回特魯克的基地。
攻擊結束以後，美軍特混艦隊随即撤離戰場，中途島之戰終于宣告結束。
在這場戰役中，美軍隻損失了1艘航空母艦、1艘驅
日本在太平洋戰場從此開始喪失戰略主動權，戰局出現了有利于盟軍的轉折。
美國海軍首腦事後評價：“中途島海戰是日本海軍350年來的第一次決定性敗仗。
它結束了日本的長期攻勢，恢複了太平洋海軍力量的均勢。
”同時，此戰還給日軍高層造成了難以愈合的創傷，使他們再也無法對戰局做出清晰的判斷。
這一痛苦的回憶，日本直到二戰結束都揮之不去。
開戰前，山本就曾說過，日本隻能堅持半年。
從1941年12月日軍偷襲珍珠港到1942年6月中途島海戰，日本果然就半年好運。
山本真是沒白在美國待那麼長時間，比那些沒出過國、自認老子天下第一的土包子同僚和愛國賊“憤青”看得準得多。
為了掩蓋自己的慘敗，避免挫傷部隊的士氣，6月10日，日本電台居然播放了響亮的海軍曲，宣稱日本已“成為太平洋上的最強國”。
當慘敗的艦隊疲憊不堪地回到駐地時，東京竟舉行提燈遊行慶祝勝利！