不久免遷，仍留居京師。
定遠侯王弼等在山東、河南、陝西練兵。
這一年有高麗、安南、占城、暹羅、真臘前來朝貢。
元也速疊兒殺其君主脫古思帖木兒另立坤帖木兒。
高麗廢君主礻禺，接着又廢君主昌。
安南黎季睺殺害其主日火昆。
洪武二十三年(1390)一月三日，晉王木岡、燕王棣率兵征讨元朝丞相咬住、太尉乃兒不花，征虜前将軍颍國公傅友德等皆聽其節制。
十五日，在南郊隆重祭祀天地。
十六日，貴州蠻叛亂，延安侯唐勝宗平定叛亂。
六日，齊王..率兵跟随燕王棣北征。
贛州賊寇作亂，東川侯胡海擔任總兵官，普定侯陳桓、靖甯侯葉升為副将，将其平定。
唐勝宗督促貴州各衛屯田。
二月十四日，藍玉平定西番蠻的叛亂。
二十二日，耕種耒昔田。
二十九日，黃河在歸德決口，發動各地軍民堵塞。
三月三十日，燕王軍隊停留迤都，咬住等人投降。
四月，吉安侯陸仲亨等人被胡惟庸一案連坐下獄。
三日，潭王梓自焚而死。
閏四月十四日，藍玉平定施南、忠建蠻的叛亂。
五月二日，将各公侯遣回故裡，分别賞賜金錢。
二十三日，将太師韓國公李善長賜死，陸仲亨等人連坐被殺。
作《昭示奸黨錄》，并公告天下。
六月四日，藍玉派鳳翔侯張龍平定都勻、散毛諸蠻。
二十九日，給有才德、知典故的老人授官。
七月二日，黃河在開封決口，進行整治。
三日，崇明、海門風雨成災，海潮泛濫，派遣官吏治理，并征集二十五萬民工築堤。
八月十三日，诏令禁止以官吏、兵士充當選舉。
藍玉返回。
當月，赈濟河南、北平、山東水災。
九月一日，日食。
十月二十一日，赈濟湖廣饑荒。
十一月二十五日，免除山東受災之地的田租。
規定凡是斬首以下的囚犯到北方邊疆種植，交粟贖罪。
十二月五日，停止天下織造文绮。
這一年，墨剌、哈梅裡、高麗、占城、真臘、琉球、暹羅前來朝貢。
洪武二十四年(1391)正月十五日，在南郊隆重祭祀天地。
二十日，颍國公傅友德被封為征虜大将軍，定遠侯王弼、武定侯郭英為副将軍，守備北平四周。
二月十五日，免去山東田租。
二十九日，耕種耒昔田。
三月一日，日食。
魏國公徐輝祖、曹國公李景隆、涼國公藍玉守備陝西邊疆。
八日，靖甯侯葉升在甘肅練兵。
十日，封賜許觀等人以進士及第等不同出身。
四月十四日，封皇子朱木旃為慶王，朱權為甯王，朱木便為岷王，朱木惠為谷王，朱松為韓王，朱模為沈王，朱楹為安王，朱逪為唐王，朱棟為郢王，朱木彜為伊王。
二十六日，燕王朱棣率傅友德諸将出塞，敗敵而歸。
五月十二日，漢、衛、谷、慶、甯、岷六位王公在臨清練兵。
六月四日，诏令廷臣參考曆代禮典制度，修改、制定冠服、居室、器用等方面的制度。
九日，長時間幹旱。
審查囚犯罪狀。
七月十五日，将一些富民遷到京師，以充實都城。
十六日，免除京畿内官員的一半田租。
八月一日，秦王朱..犯罪，召回京師。
九月九日，皇太子巡撫陝西。
十一日，都督佥事劉真、宋晟讨伐哈梅裡，将其擊敗。
二十一日，派人出使西域。
當月，倭賊攻打雷州，百戶李玉、鎮撫陶鼎戰死。
十月四日，免除北平、河間遭受水災地方的田租。
十一月十二日，五開蠻叛亂，都督佥事茅鼎平定叛亂。
二十八日，皇太子返回京師，晉王木罔前來朝見。
二十九日，赈濟河南水災。
十二月十八日，周王木肅返回封地。
二十九日，阿資又反，都督佥事何福讨伐，降服了阿資。
這一年，天下郡縣賦役黃冊編成，共計一千零六十八萬四千四百三十五戶，五千六百七十七萬四千五百六十一人。
琉球、暹羅、别失八裡、撒馬兒罕前來朝貢。
占城因有篡位之事，拒受其朝貢。
洪武二十五年(1392)一月六日，周王朱木肅前來朝見。
二月八日，黃河在陽武決口，征集軍民堵塞，免除受水災之地的田租。
十三日，在南郊隆重祭祀天地。
何福平定都勻、畢節諸蠻。
十九日，規定死囚，納粟到塞下贖罪。
二十日，晉王朱木罔，燕王朱棣、楚王朱桢、湘王朱柏前來朝見。
二月七日，召曹國公李景隆等人返回京師。
靖甯侯葉升等人在河南及臨、鞏、甘、涼、延慶練兵。
都督茅鼎等人平定五開蠻。
十五日，耕種耒昔田。
二十九日，诏令天下衛所軍隊抽出十分之七屯田。
三月二日，馮勝等十四人分别料理陝西、山西，河南諸衛軍務，三月九日，改封豫王朱桂為代王，漢王朱木英為肅王，衛王朱植為遼王。
四月一日，涼國公藍玉出征罕東。
二日，建昌衛指揮月魯帖木兒叛亂，被指揮魯毅擊敗。
二十五日，皇太子朱标死去。
二十七日，都督聶緯、徐司馬、瞿能讨伐月魯帖木兒，等藍玉返回，一并受其節制。
五月一日，藍玉到達罕東，叛軍逃跑，于是趨兵建昌。
九日，赈濟陳州、原武水災。
六月十日，西平侯沐英死于雲南。
七月一日，秦王朱..返回封地。
四日，指揮瞿能在雙狼寨打敗月魯帖木兒。
八月十日，江夏侯周德興連坐被誅。
十八日，馮勝、傅友德率領開國公常升等分行山西，籍民為軍。
在大同、東勝屯田，建立了十六衛。
二十五日，供給王公諸侯每年的俸祿，歸賜田地于官。
二十七日，靖甯侯葉升連坐胡惟庸一案被誅。
九月十二日，冊立皇孫允火文為皇太孫。
高麗李成桂囚禁其主瑤而自立為王，借國人之名上表請命，诏令允奏，改其國号為朝鮮。
十月二十七日，沐春承襲封号西平侯，鎮守雲南。
十一月十七日，藍玉擒獲月魯帖木兒，處死，召回藍玉。
十二月二十八日，宋國公馮勝、颍國公傅友德等人兼任東宮師保官。
閏十二月二十二日，馮勝擔任總兵官，傅友德為副總兵，在山西、河南練兵，兼任領屯衛。
這一年，有琉球、中山、山南、高麗、哈梅裡前來朝貢。
洪武二十六年(1393)正月二日，規定天下耆民免朝。
十五日，在南郊隆重祭祀天地。
二月二日，晉王朱木岡統領山西、河南軍隊出塞，召回馮勝、傅友德、常升、王弼等人。
十日，蜀王朱椿來京朝見。
涼國公藍玉因為謀反被誅，鶴慶侯張翼、普定侯陳桓、景川侯曹震、舳舻侯朱壽、東莞伯何榮、吏部尚書詹徽等都被連坐誅殺。
十四日，頒發逆臣錄于天下。
十五日，耕種耒昔田。
三月六日，代王朱桂率護衛兵出塞，受晉王節制。
長興侯耿炳文在陝西練兵。
十一日，馮勝、傅友德守衛山西、北平邊防，其屬衛将校都受晉王、燕王節制。
十五日，诏令晉、燕二王，重要軍務要事先奏知。
十七日，會甯侯張溫連坐于藍玉一案而被誅殺。
四月一日，孝感發生饑荒，派人開官倉、貸糧赈饑。
诏谕自今以後，發生饑荒，先貸後奏，定為制度。
十七日，周王朱木肅來京朝拜。
十九日，天氣幹旱，要群臣直言其得失，審查監獄的囚犯。
二十五日，由于安南擅自廢立君主，拒絕接受其朝貢。
七月一日，日食。
五日，選拔秀才張宗..等人跟随詹事府官到文華殿，侍候皇太孫。
八月，秦、晉、燕、周、齊五王前來朝見。
九月十一日，代、肅、遼、慶、甯五王來京朝拜。
赦免胡惟庸、藍玉餘黨。
十月二十四日，提升國子監生六十四人擔任布政使等官職。
十二月，給諸王頒發《永鑒錄》。
這一年，琉球、爪哇、暹羅前來朝貢。
洪武二十七年(1394)正月十五日，在南郊祭祀天地。
二十一日，封李景隆為平羌将軍，鎮守甘肅。
各地開倉貸糧給貧民百姓。
三月一日，封賜張信等人以進士及第和其他不同的出身。
二日，魏國公徐輝祖、安陸侯吳傑在浙江防備倭寇。
十一日，督促百姓種植桑、棗、木、棉。
二十五日，由于四方平定，收藏兵器，表示永不複用。
八月七日，吳傑以及永定侯張铨率領辭官的武将，在廣東防備倭寇。
八日，派國子監生前往各地，督促官吏、百姓興修水利。
十九日，階、文軍隊叛亂，都督甯正被封為平羌将軍前往征讨。
九月，徐輝祖節制陝西沿邊各路軍隊。
十一月二十九日，颍國公傅友德犯罪被誅。
阿資又反，西平侯沐春将其擊敗。
十二月，定遠侯王弼犯罪被殺。
這一年，烏斯藏、琉球、緬、朵甘、爪哇、撒馬兒罕、朝鮮來京朝貢。
安南前來朝貢被拒絕。
洪武二十八年(1395)正月十日，階、文賊寇平定，甯正率兵跟随秦王朱..征伐洮州叛番。
十二日，在南郊祭祀天地。
二十九日，西平侯沐春擒斬阿資，平定越州。
當月，周王朱木肅、晉王朱木岡率領河南、山西各衛軍隊出塞，修築城防和屯田。
燕王朱棣率總兵官周興出遼東要塞。
二月三日，宋國公馮勝犯罪被殺。
二十五日，诏谕戶部編民以一百戶為一裡。
遇婚喪病死以及其他困難，裡中富裕的人幫助錢财，貧窮的人助力。
春耕秋收，通力合作，以便百姓和睦。
六月十日，诏令各地土司都要提倡儒學。
十九日，周興等人從開原追敵到甫答迷城，沒能趕到，于是返回。
二十七日，皇帝在奉天門對群臣說：“我起兵到今天有四十多年了，灼見情僞，懲治奸頑，有時不按法典用刑，這不能長久。
以後，隻能按照法典與大诰辦事，不許用黥、刺、非刂、劓、閹割等刑罰。
對敢請求施酷刑的人要從重處罰。
”又說“：我廢除丞相，設置府、部、都察院分管各種事務，大權歸于朝廷。
以後的君王不準再設丞相。
有為臣的膽敢請求設置，從重處罰。
皇親犯謀逆之罪，嚴懲不赦。
我，犯法，由宗親會議從嚴制裁。
法司隻許上奏檢舉，不得擅自捕人。
嚴格制定這些典章，永世遵守。
”
八月六日，封都督楊文為征南将軍，指揮韓觀、都督佥事宋成為副将軍，讨伐龍州土官趙宗壽。
七日，信國公湯和死去。
二十日，趙宗壽來朝謝罪，楊文又率兵讨伐奉議、南丹叛蠻。
九月六日，免除京畿、山東秋糧。
十九日，向天下頒發皇明祖訓條章，“後人若有談論更改祖制的，以奸臣論處”。
十一月十五日，奉議、南丹蠻都被平定。
十二月三日，诏令對河南、山東栽種桑棗以及二十七年(1394)以後新開墾的土地，不要征稅。
這一年，朝鮮、琉球、暹羅來京朝貢。
洪武二十九年(1396)一月十五日，在南郊祭祀天地。
二月十五日，征虜前将軍胡冕讨伐郴、桂蠻，予以平定。
二十三日，燕王朱棣率兵巡視大甯，周世子有墩領軍巡視北平關隘。
三月四日，楚王朱桢、湘王朱柏入京朝見。
七日，燕王朱木肅在徹徹兒山打敗敵軍，又追剿到兀良哈秃城後返回。
八月二十二日，免除應天、太平五府田租。
九月二十日，召見辭官的武将二千五百多人，大加賞賜，并加一級俸祿。
這一年，琉球、安南、朝鮮、烏斯藏來京朝貢。
洪武三十年(1397)一月三日，封耿炳文為征西将軍、郭英為副将軍，巡視西北邊防。
十三日，在南郊祭祀天地。
十四日，在山西、北平、陝西、甘肅、遼東設置流動的太仆寺，掌管馬匹管事宜。
十六日，左都督楊文在遼東屯田。
當月，沔縣盜賊起事，诏令耿炳文征讨。
二月七日，水西蠻叛亂，都督佥事顧成被封為征南将軍，平定反叛。
三月一日，賜封陳安阝等人以進士及第等不同的出身。
二十八日，古州蠻反叛，龍裡千戶吳得、鎮撫井孚戰死。
四月十七日，都指揮齊讓被封為平羌将軍，前往征讨。
二十日，平定水西蠻。
五月一日，日食。
四日，楚王朱桢、湘王朱柏率兵讨伐古州蠻。
六月一日，封賜禮部覆試貢士韓克忠等人以進士及第等不同的出身。
二十九日，驸馬都尉歐陽倫犯罪被賜死。
八月八日，黃河在開封決口。
十五日，李景隆被封為征虜大将軍，在河南練兵。
九月一日，漢、沔賊寇被平定。
十九日，麓川平緬土酋刀幹孟追随宣慰使思倫發反叛。
二十六日，都督楊文代替齊讓擔任征虜将軍。
十月十日，停止遼東海運。
十三日，耿炳文在陝西練兵。
七日，重建國子監先師廟完工。
十一月二十五日，沐春為征虜前将軍，都督何福等人為将軍，讨伐刀幹孟。
這一年有琉球、占城、朝鮮、暹羅、烏斯藏、泥八剌入京朝貢。
洪武三十一年(1398)正月十四日，在南郊祭祀天地。
十七日，派人到山東、河南督促農耕。
二月八日，倭寇攻打甯海，被指揮陶铎擊敗。
二十四日，平定古州蠻，召回楊文。
二十七日，都督佥事徐凱平定麼些蠻。
四月四日，廷臣以朝鮮屢生事端為由，請求讨伐，未準。
五月初一日，沐春大敗刀幹孟。
八日，皇上患病。
十二日，都督楊文跟随燕王朱棣，武定侯郭英跟随遼王朱植，在開平守備，俱受燕王節制。
閏五月八日，皇上病情惡化。
十日，駕崩于西宮，終年七十一歲。
遺诏說：“我在位三十一年，憂心于天下，日夜操勞，以求有益于民。
無奈出身寒微，無古人之博識，揚善懲惡，做得很不夠。
現在順其萬物自然的法則，沒有必要哀念。
皇太孫允火文英明仁孝，受天下擁戴，應繼承皇位。
内外文武大臣要齊心輔佐，以使天下安定。
喪禮祭祀所需的東西，不要用金銀器皿。
孝陵的山水保持原貌，不要改變。
天下臣民，哀悼三天之後，全部脫去孝服，以免影響嫁娶之事。
諸王留在封地，不要前往京師。
此诏令未說之事，按诏令意思酌情辦理。
”十六日，安葬于孝陵。
被追封為高皇帝，廟号為太祖。
永樂元年(1403)，追封為聖神文武欽明啟運俊德成功統天大孝高皇帝。
嘉靖十七年(1538)，進而追封為開天行道肇紀立極大聖至神仁文義武俊德成功高皇帝。
太祖皇帝有天授智勇，統一華夏，文韬武略，為漢、唐、宋各代君主所不及。
開始之初，能深藏不露，靜觀變化，戰略順序，成算在胸。
曾與各位臣僚談論奪取天下的謀略，說：“我遭遇戰亂，起事于窮鄉僻壤，本來隻想保全自己。
到渡江以後，看群雄的所作所為，隻是使百姓遭受災難，其中張士誠、陳友諒尤為突出。
士誠可憑借财富，友諒憑借強大，唯獨我沒有依靠。
隻是不喜殺人，提倡信義，厲行節儉，與各位同舟共濟。
起初與張、陳二寇相持，士誠與我更接近，有的人建議要先攻擊他。
我認為友諒性格驕狂，士誠器量窄小，性格驕狂則喜歡挑起戰事，器量窄小則沒有遠大抱負，因此要先進攻友諒。
鄱陽之戰，士誠軍隊沒有邁出姑蘇一步去進行援救。
如果先進攻士誠，浙西憑借牢固城防堅守，友諒必然率全部兵馬趕來，我就會腹背受敵。
除掉二寇，北上平定中原，之所以先攻山東，再進河洛，而停止潼關兵馬不去攻取秦、隴，是因為擴廓帖木兒、李思齊、張思道雖經百餘戰卻勝負未分，急于進攻，他們就會聯合一起抵抗，短期内不能平定他們，因此，出其不意，反而率軍北上。
燕都既然攻克，再行西征。
張、李勢單力薄，于是不戰而勝，然而擴廓還拼力抵抗。
如果不先攻下燕都，就急于與他角逐，勝負就難說了。
”太祖皇帝的雄才大略，制勝于敵，可見一斑。
因此，他能平息禍亂，取得天下。
有道是“後來者居上的道理”豈是偶然的嗎？
評論：太祖憑聰明神武的天資，胸懷濟世安民之志，審時度勢，豪傑景仰，平定戰亂，消除強暴，十五年完成帝業。
從一介布衣到基業覆蓋海宇，自西漢以後從未有過。
吸取元朝政治廢弛的教訓，整肅政治。
而且對耆儒以禮相待，考查制定禮典樂章，彰明經義，尊崇正學，施恩于亡國亡地，澄清吏治，修定做人準則，尊崇風俗宗教，正後宮名義，内治肅清，禁止宦官太監幹預政事，五府六部官職互相牽制，設衛屯田，兵器糧食充足。
以武平定禍亂，以文建立太平盛世，太祖一身兼有。
在崇尚節義方面，允許蔡子英北歸。
晚年更加憂民，曾以一年的時間開挖支河數萬處河渠塘堰，以利農桑，預防旱災。
憑借這些，其子孫承襲基業二百多年，士重名義，平民充實。
至今後代蒙受恩澤，就如東樓、白馬，世代相傳祭祀太祖，享受這些決不是平白無故的啊！