張獻忠遂進入河南。
八月，李自成攻克鹹陽，将領高傑投降。
十五日，下诏撤回監視總理内臣，隻有京師營兵及關、甯保持原來一樣。
二十四日，盧象升總理直隸、河南、山東、湖廣、四川軍務。
九月四日，洪承疇監督副将曹變蛟等在關山鎮打敗李自成。
李自成向東逃去，與張獻忠會合。
十五日，官軍在沈丘瓦店失敗，總兵官張全昌被捉。
二十五日，王應熊辭官退職。
十月三日，下诏責罰自己，避居武英殿，減少膳食，不興音樂，表示與将士同甘共苦。
九日，戶部尚書侯恂請求嚴格征收新舊欠交賦稅，皇帝采納了他的建議。
十四日，李自成攻克陝州。
十一月四日，何吾驺、文震孟辭官退職。
十四日，祭祀天于京師南郊。
總兵官祖寬在汝州攻破流賊。
十二月二日，駐兵于鳳陽。
九日，盧象升、祖寬在确山打敗李自成。
十二日，左良玉在阌鄉打敗流賊。
十七日，流賊侵犯長江北岸，圍攻滁州。
二十九日，老回回諸賊從河南侵犯陝西，被洪承疇打敗于臨潼。
這年，安南、暹羅、琉球來朝進貢。
崇祯九年(1636)正月八日，總理侍郎盧象升、祖寬救援滁州，大敗流賊于朱龍橋。
二十一日，前禮部侍郎林钅幹以原官兼東閣大學士，參與機要事務。
二月，前副将湯九州在嵩縣與流賊戰鬥中戰死。
山西大饑荒，人相殘食。
十日，甯夏饑荒，發動兵變，殺巡撫都禦史王楫。
兵備副使丁啟睿撫安平定甯夏。
十六日，以武舉人陳起新為給事中。
三月，盧象升、祖大樂征剿河南流賊。
高迎祥、李自成分部進入陝西，餘部從光化進入湖廣。
赈救南陽饑民，免山西受災州縣新、舊二饷。
四月十四日，錢士升辭官退職。
五月九日，下诏赦免協助作亂諸賊。
願意歸附的，護送其回鄉，官吏安排職務；願意随軍效力的，有功一樣記錄在案并賞賜。
十三日，延綏總兵官俞沖霄在安定攻打李自成，失敗而死。
李自成侵犯榆林，被賀人龍打敗。
三十日，免畿内五年以前欠交賦稅。
六月二日，林钅幹死。
十一日，吏部侍郎孔貞運，禮部尚書賀逢聖、黃士俊，均為禮部尚書兼東閣大學士，參與機要事務。
二十六日，總兵官解進忠在淅川安撫流賊，被殺害。
七月二日，内臣李國輔等分守紫荊、倒馬諸關。
八日，成國公朱純臣巡視邊關。
十一日，下诏各鎮星夜兼程赴京救援。
十七日，大清兵進入昌平，巡關禦史王肇坤戰死。
二十日，巡撫陝西都禦史孫傳庭在銩稨捉拿流賊首領高迎祥，押送京師殺害。
二十一日，告訴廷臣幫助軍饷。
二十二日，兵部尚書張鳳翼領導援軍，高起潛為總監。
這月，大清兵進入寶坻，接連攻克近畿州縣。
八月二日，收集勳戚文武諸臣馬匹。
二十四日，盧象升入京救援，臨時駐紮真定。
二十五日，唐王朱聿鍵起兵救援京師，勒令其回到封國，不久廢為庶人。
本月，大清兵出塞。
九月二十日，改用盧象升總督宣府、大同、山西軍務。
十月四日，工部侍郎劉宗周因談論内臣及大學士溫體仁被革職。
十三日，張獻忠侵犯襄陽。
二十五日，命令開銀、鐵、銅、鉛各礦。
十一月七日，減免山東五年以前欠交賦稅。
十二月，大清兵出征朝鮮。
當年，洪承疇在隴州打敗李自成，李自成逃往慶陽、鳳翔一帶。
暹羅入朝進貢。
崇祯十年(1637)正月初一日，有日食。
六日，老回回諸賊直趨長江以北，張獻忠、羅汝才從襄陽侵犯安慶，南京大為震懾。
二月四日，派使者監督直隸省欠交賦稅。
二十七日，賊軍進攻潛山，被總兵官左良玉、副使史可法在楓香驿打敗。
這月，朝鮮向大清兵投降。
三月十二日，赈救陝西災害。
十八日，賜劉同升等進士及第、出身各有差别。
二十五日，官軍救援安慶，在豐家店慘遭失敗。
四月九日，大清兵攻克皮島，副總兵金日觀奮力戰死，總兵官沈冬魁敗走石城島。
二十四日，天旱，清理刑獄。
本月，洪承疇在漢水以南征剿流賊。
閏四月四日，命令群臣自己廉潔，愛護平民，以使上天回心轉意。
長江以北流賊分别侵犯河南，總督兩廣都禦史熊文燦為兵部尚書，總理南京、河南、山西、陝西、四川、湖廣軍務，駐兵鄖陽征讨流賊。
五月十一日，李自成從秦州侵犯四川。
六月十一日，溫體仁辭官退職。
當年夏天，兩畿、山西大旱。
七月，山東、河南蝗災，平民饑荒。
八月十四日，吏部侍郎劉宇亮、禮部侍郎傅冠均為禮部尚書，佥都禦史薛國觀為禮部侍郎，一同兼東閣大學士，參與機要事務。
二十五日，檢查城防情況。
九月十一日，左良玉在虹縣打敗流賊。
二十六日，洪承疇在漢中打敗流賊。
二十八日，李自成攻陷甯羌。
十月二日，李自成從七盤關進入西川。
八日，攻陷昭北、劍州、梓潼，分兵直趨潼川、江油、綿州，總兵官侯良柱戰死，于是攻克彰明、鹽亭各縣。
十六日，逼近成都。
十一月十六日，因星宿變化命令修身反省，要求講直話。
十二月九日，黃士俊辭官退職。
二十九日，洪承疇、曹變蛟增援四川，住于廣元。
這年，安南、琉球入朝進貢。
崇祯十一年(1638)正月十三日，洪承疇在梓潼打敗李自成，李自成回師陝西。
二十三日，裁減南京多餘官員。
二月十日，改河南巡按都禦史張任學為總兵官。
三月十五日，賀逢聖辭官退職。
這月，李自成從洮州出番地，被總兵官曹變蛟追擊失敗，李自成再次入塞。
率軍到西和、禮縣。
四月八日，張獻忠在谷城假裝投降，熊文燦受降。
十五日，張至發辭官退職。
十六日，火星逆向行駛，告訴廷臣修身反省。
五月初一日，在中左門策試考選官。
六月二日，安民廠發生災害，城垣被毀壞，萬餘人受傷。
十一日，孔貞運辭官退職。
二十四日，兵部尚書楊嗣昌、戶部尚書程國祥、禮部侍郎方逢年、工部侍郎蔡國用均為禮部尚書，大理少卿範複粹為禮部侍郎，一同兼東閣大學士，參與機要事務。
楊嗣昌仍然掌管兵部。
這月，兩畿、山東、河南大旱，起蝗蟲。
七月四日，少詹事黃道周因談論楊嗣昌父喪未辭官守孝一事，貶為按察司照磨。
八月八日，因多次出現災害和異常情況，居永壽宮行齋，告訴廷臣修身反省。
二十三日，傅冠辭官退職。
二十八日，停止用刑。
羅汝才等從陝州侵犯襄陽。
九月，陝西、山西天旱饑荒。
二十二日，大清兵進入牆子嶺，總督薊遼兵部侍郎吳阿衡戰死。
二十四日，京師戒嚴。
十月四日，盧象升入京救援，皇帝在武英殿召對他。
五日，招買馬匹。
盧象升、高起潛分别領導援軍。
這月，洪承疇、曹變蛟大敗李自成于潼關南原，李自成隻率騎兵數人逃走。
十一月十日，大清兵攻克高陽，退職大學士孫承宗戰死。
三十日，罷免盧象升，準其帶罪立功。
劉宇亮自己請求視察軍隊，得到同意。
這月，羅汝才投降。
十二月十二日，方逢年停職。
盧象升在巨鹿兵敗而死。
二十日，孫傳庭為兵部侍郎監督援軍，征調洪承疇入京守衛。
當年，土魯番、琉球入朝進貢。
崇祯十二年(1639)正月一日，因時事艱難多難，拒絕朝臣慶賀。
二日，大清兵進入濟南，德王朱由樞被活捉，布政使張秉文等死。
十日，劉宇亮、孫傳庭會師十八萬人于晉州，但不敢前進。
十九日，改洪承疇鎮守薊、遼二州，孫傳庭總督保定、山東、河北。
二月七日，劉宇亮停職。
大清兵引兵北回。
三月九日，出青山口，共深入内地二千裡，經曆五個月，攻下畿内、山東七十餘城。
十九日，加上孝純皇太後谥号，诏告天下。
四月二十一日，程國祥辭官退職。
這月，左良玉攻擊降賊首領李萬慶。
五月八日，禮部侍郎姚明恭、張四知、兵部侍郎魏照乘均為禮