征伐福建。
章溢回答說“：湯和取海路、胡美由江西前去征讨，必定勝利。
但李文忠在福建尤其有威信，如果命李文忠從浦城攻取建甯，将是萬全之計。
”太祖當即按章溢的策劃，下诏命李文忠出師。
處州軍糧舊額為一萬三千石，戰事興起後加至以前的十倍。
章溢向丞相建議，恢複了舊額。
浙東建造海船，在處州征求巨木。
章溢說道：“處州、婺州相交之處，山岩峻險，縱然有木材，從什麼路運出去呢？”因而告訴行省停辦此事。
洪武元年(1368)，章溢與劉基同被授予禦史中丞兼贊善大夫。
當時廷臣窺探皇帝的意圖，辦事大多嚴厲苛刻，唯獨章溢能持大體。
有人因此勸說他。
章溢卻說“：憲台為百司的儀表，應當教人懂得廉恥，豈能以相互攻讠幹抨擊為能呢？”太祖親自去祭祀社稷，卻遇上了大風雨，回來之後坐在外朝，怒說禮儀不合，以緻變天。
章溢委婉說明自己無罪，太祖才寬恕了他。
李文忠征伐福建，章存道率所部鄉兵一萬五千人随往。
福建平定後，太祖下诏命李存道率所部從海路北征。
章溢堅持不可，說：“鄉兵都是農民，曾允諾讓他們在福建平定後回鄉務農，現在又調去北征，這是不講信用啊。
”太祖聽後不悅。
章溢不久又奏道“：已經進入福建的鄉兵，讓他們返回故鄉。
而對那些過去曾是叛逆的百姓，應當征召為兵，命其北上，這樣便可一舉兩得，恩威并顯。
”太祖高興地說“：誰說儒者迂遠而不切實際呢？沒有先生一行，便無人能辦此事。
”章溢行至處州時，恰逢母親去世，請求回鄉居喪守孝。
太祖不許。
鄉兵聚集之後，章存道受命由永嘉出發，由海路北上，章溢再次奏請回鄉守喪。
太祖下诏答應其請求。
章溢悲戚過度，殓葬時又親自背運土石，終也染病去世，終年五十六歲。
太祖悲痛哀悼，親自撰文，到章溢家中祭奠。