，劉吉請皇上敬修德行，防微杜漸，慎終如始。
八月，他又因有災異上陳七項建議。
代王獻海東青(雕)，劉吉等人說登基诏書中已說要辭退四方的貢獻，請不要接受。
第二年三月，劉吉與同僚上書說：“陛下體質較差，與先帝不同。
凡是宴樂遊觀，一切嗜好之事，都應當減省。
左右近臣如果有人請陛下照先帝那麼做的，陛下當引太祖、太宗的典故将他斥退。
祖宗過節和歡宴遊樂都有節制，陛下效法祖宗就行了。
”吐魯番使者進貢獅子後回去，皇上令内閣起草敕書，派宦官去送他們。
劉吉等人說不宜對他們優寵太過，使番戎之人輕視中國。
這事于是撤消了。
後來劉吉又說：“獅子等野獸，每天要喂兩隻羊，每年要用去七百二十隻，還要每天用五十名校尉看守，這都是繁重的耗費。
應該對各野獸絕食，讓它們處斃。
”皇上不能采納。
十二月，有星變，劉吉又說“：近來有妖星出天津，經過杵臼，逼近營室。
這個天象主兵、主饑、主水旱之災。
現在南北兩京畿、河南、山西、陝西有蟲災旱災，四川、湖廣年成不好。
如果明年還是這樣，恐怕盜賊竊發，禍亂将會發生。
願陛下節約開支，停罷遊宴，屏退讒言，斥出異教，留心誦讀經史，講求治國之道。
沙河修橋、江西造瓷器、南海子修繕城垣，這些工程都不緊要，應全部停止。
”皇上嘉許采納了。
皇上被近臣之言所迷惑，很崇尚祈禱之事，發出經牌令閣臣作贊，又令他們草拟神将的封号。
劉吉等人極力建議這種邪說應當廢斥。
劉吉從孝宗即位之初升為少傅，兼太子太師、吏部尚書。
到《憲宗實錄》修成後，又進升為少師、華蓋殿大學士。
他執政歲久，權勢煊赫。
皇上當初很傾心于他，對他很信任聽從，後來對他的寵愛稍衰，但劉吉仍沒有離去之意。
五年(1492)，皇上想封皇後的弟弟為伯爵，命劉吉撰寫诰券。
劉吉說一定要一起封兩位太後的家人子弟才行。
皇上不高興，派宦官到他家，暗示讓他退休，劉吉這才上書引退。
诏令賜給他敕書，讓他照舊例坐驿車回去。
劉吉多智謀，善于附會和自我掩飾，攀附權貴，銳于營私，常常受言路攻擊。
他在内閣十八年，人們稱他為“劉棉花”，因為他很耐彈(劾)。
劉吉懷疑這話是出于落第的舉人，便請求舉人三次會試不中的，不得再參加會試。
當時适逢會試之期，舉人都已群集京師，禮部為劉吉請示皇上。
皇上下诏說姑令他們入試，以後再如劉吉所請。
過後劉吉被罷免，這項規定也就沒有實行。
劉吉回去後，過了一年去世，贈太師，谥文穆。