然無事呢？并且曹欽的變亂，是由逮杲刺探消息激成的，這事可作為借鑒。
自從汪直專權用事以來，士大夫不安于職守，商人不安于營生，庶民不安于作業，如不盡快将他除去，那麼天下安危就難以預料了。
”皇上不高興地說：“用一個内豎，何至于危及天下！是誰主持這項奏議的？”皇上命太監懷恩傳下聖旨，嚴加斥責。
商辂正色說道：“朝臣無論大小，犯了罪都得要請聖旨才能逮問，而汪直卻擅自抄三品以上京官的家。
大同、宣府，是邊城要害，守備一刻也不能缺人，而汪直一天要抓走數人。
南京是祖宗根本之地，其留守大臣，汪直也敢擅自收捕。
那些在皇上左右侍奉的人，汪直也擅自更換。
汪直不除去，天下怎能安甯？”萬安、劉王羽、劉吉也都上奏皇上，慷慨陳詞，懷恩等人為之屈服。
商辂對同僚感謝道：“諸公都這麼忠心為國，我商辂還有什麼要擔憂的呢？”正好九卿項忠等人也彈劾汪直，這天遂罷設西廠。
汪直雖然不管廠事，但皇上對他寵幸如故。
他誣陷商辂曾經收下指揮楊晔的賄賂，想為他開脫罪責。
商辂心中不安，而禦史戴缙又歌頌汪直的功勞，請求重開西廠，商辂于是堅持要求辭職。
皇上下诏加封少保，命令用驿車送回家。
商辂離開後，士大夫們更俯首聽命于汪直，沒有人敢與他對抗了。
錢溥曾經因為不得升官，作《秃婦傳》譏諷商辂。
高瑤請求恢複景帝的稱号，黎淳上書反駁，并極力诋毀商辂。
商辂都不加以計較，依然和平常一樣對待他們。
萬貴妃敬重商辂的名聲，曾拿出她父親的畫像，請商辂寫一篇贊文，報以豐厚的金帛。
商辂極力推辭，使者說這是貴妃的意思。
商辂說“：不是皇上的命令，我不敢應承。
”貴妃很不高興，但商辂終于還是不答應。
商辂就是這麼和氣而又講原則。
商辂辭官回家後，劉吉去拜訪他，見他兒孫滿堂，歎道：“我與您共事多年，沒有見您筆下枉殺過一個人，您是應該得到上天的厚報的。
”商辂說“：我隻是不敢讓朝廷妄殺一個人而已。
”家居十年去世，終年七十三歲。
贈太傅，谥文毅。