少卿。
胡宗憲說唐順之權力小，不宜于指揮戰事，又加職為右通政。
唐順之聽說海寇将進犯江北，于是急令總兵官盧镗在三沙島阻擊，自己率副總兵劉顯迅速增援，與鳳陽巡撫李遂合力大敗海寇于姚家蕩。
海寇困窘，退駐廟灣。
唐順之乘勢進擊，殺傷部分敵人。
李遂意欲将敵人圍困起來，唐順之覺得這不是辦法，于是指揮進攻敵人營寨，用火炮攻擊，但沒有攻克。
三沙島的官軍又頻頻告急，唐順之于是又率兵增援三沙，督率盧镗、劉顯進攻，卻先後兩次失利。
唐順之十分憤恨，親自躍馬布陣，海寇構築了高高的..望樓，在樓上看見唐順之軍伍整齊，因而堅守陣地而不出戰。
見此情形，劉顯請求退兵，唐順之不同意，他手提戰刀，沖到距敵人營地百多米處，盧镗、劉顯擔心出事，堅決要唐順之退回。
這時正值酷暑，唐順之在海船中居留兩月之久，染上了疾病，于是返回太倉。
李遂調任南京，唐順之即升為右佥都禦史，并代李遂為鳳陽巡撫。
唐順之病日益沉重，由于戰事棘手，他不便辭職歸養。
唐順之到達江北時，海盜已被李遂等人剿滅。
這時淮、揚二州發生了大饑荒，唐順之因而上疏提出了加強海防、處理善後事宜等九條措施。
嘉靖三十九年(1560)春天，汛期到了，唐順之帶病巡視海上，過焦山，至通州病逝，時年五十四歲。
訃告傳到京師，皇帝令公祭安葬。
按常規，四品官隻賜祭，而不賜葬，唐順之因為國辛勞而死，所以得到皇帝賜葬的禮遇。
唐順之學識淵博，天文、樂律、地理、兵法、弧矢、勾股、壬奇、禽乙諸學，無不探究原委。
他還從古今文獻中摘錄有關資料，按類别分為左、右、文、武、儒、稗六編，傳播于世，因其内容深奧讀書人也不能理解其奧妙。
唐順之作古文辭，汪洋恣肆有大家風範。
平生節儉勤苦，以破舊的門闆拼成床榻，鋪蓋也簡樸得很。
他曾師從王畿習良知之學，閉門獨坐，整月都忘掉睡覺，在靜坐中頗有所得。
晚年由趙文華推薦出山，他曾就此事商議于羅洪先。
羅洪先說“：你從前已隸屬官籍，你的身子并非你自己所有，怎麼能和一般隐士相比？”唐順之于是出任，然而他的聲名亦因此頗受損害。
崇祯中年，追贈唐順之“襄文”谥号。