廣西參議，也被彈劾罷去官職。
趙錦在家居住十五年，穆宗即位後，被起用為故官。
提升為太常少卿，還沒有上任，又晉官光祿卿。
江陰年進納子鲚萬斤，趙錦上奏減為一半。
隆慶元年(1567)以右副都禦史的官職巡撫貴州，趙錦破擒叛苗龍得魚乍等人。
宣慰安氏向來桀骜，但畏怕趙錦，因此為他效命。
趙錦被調入朝廷任大理卿，曆工部左、右侍郎。
曾經署理部事，于事有所争論堅持。
萬曆二年(1574)趙錦升遷為南京右都禦史，後改任刑部尚書。
張居正遭喪，南京大臣議論上疏将他留用，趙錦和工部尚書費三..不同意才停止。
趙錦被調到禮部，又到吏部，都在南京任職。
趙錦說“：世宗登記嚴嵩家，禍延及江西諸府。
張居正的私藏未必趕得上嚴氏，如果加以搜索，恐怕要贻害三楚，受害将十倍于江西草民。
而且張居正确實是專權，但沒有異志。
他輔佐幼年天子，早晚勤勞，中外甯谧，功勞也有不容泯滅的。
現在他的官蔭贈谥和諸個兒子的官職一并随他被革除，這已足以示懲，乞求皇上同情原諒他，稍微放寬對他的懲罰。
”皇帝不采納他的意見。
趙錦二品官六年滿後，被加封為太子少保，不久被加封為兵部尚書，掌管院事同過去一樣。
趙錦摘陳禦史封事可采用的數條，請皇上下旨推行。
四川巡按名隹遵怨恨趙錦，假借條奏指責趙錦為奸臣。
禦史周希旦、給事中陳與郊認為名隹遵不對，交章論奏名隹遵，于是調名隹遵出朝廷外任職。
皇帝到山陵去，趙錦再奉敕命居守。
這一年冬天，趙錦因繼母死去而回到家鄉。
十九年(1591)召封趙錦為刑部尚書。
趙錦七十六歲了，再次辭官，皇帝不許。
趙錦臨時住宿在蘇州時死去。
贈官太子太保，谥号端肅。
趙錦始終厲行清操，笃信王守仁學說，而教人則以身體力行為本。
王守仁從祀孔廟，趙錦是出了力的。
早先忤逆嚴嵩，遭得重禍。
等到在貴州做官，經過嚴嵩鄉裡，看見嚴嵩葬在路旁，又恻然憐憫他，囑咐有司派人護視。
後來趙錦忤逆張居正被罷官，張居正被抄家時，趙錦又予營救。
人們因此稱趙錦有長者風度。