王崇古，字學甫，蒲州人。
嘉靖二十年(1541)的進士。
授職為刑部主事。
由郎中始，曆任安慶知府、汝甯知府。
調任兵備副使，在夏港打擊倭寇，在靖江追殲了一股倭寇。
跟随巡撫曹邦輔在浒墅作戰。
此後，與俞大猷一起将倭寇追逐出海。
他升任陝西按察使，河南右布政使。
嘉靖四十三年(1564)，他改任右佥都禦史，轄治甯夏地區。
王崇古喜歡談論軍事，完全知曉各邊關的險隘要塞，親身經曆搏殺，組織抵抗防守，接受投降和歸附的人，屢次出兵直搗敵人的巢穴。
敵寇屢屢殘害其他的邊鎮，唯獨甯夏完好。
隆慶初年，他被加封為右副都禦史。
吉囊的兒子吉能占據河套做了西部邊疆各部落的首領，另有賓兔部落在大、小松山紮營放牧，向南騷擾河、湟地區的西南少數民族，敵寇包圍了四個鎮。
總督陳其學既無威望又無謀略，總兵官郭江、黃演等人都戰敗而死，陝西巡撫戴才也被免職。
當年冬天，王崇古升任兵部右侍郎兼右佥都禦史，統轄陝西、延綏、甯夏、甘肅地區的軍務。
王崇古上奏請求給四鎮發放旗牌，使撫按大臣能夠按軍法督察戰事，他還根據地圖，劃出防區，分别授予趙岢、雷龍等諸位大将。
他屢次立功。
着力兔在河東遊牧，雷龍偷偷由興武出發，襲擊并攻破敵營，斬殺了許多人，王崇古被加封為右都禦史。
吉能侵犯邊關，被執行秋季防守任務的部隊遏制了，他們移駐白城子。
雷龍等人奔出花馬池、長城關與他們作戰，大敗敵人。
王崇古在陝西呆了七年，前後獲得很多戰績。
從河套以東到宣府、大同等邊關之外，是吉囊的弟弟俺答、昆都力紮營放牧的地方。
再向東到薊鎮、昌平以北的地區，吉囊、俺答的首領居住在那裡，他們都很強盛。
俺答又收留了叛賊趙全等人，占據古豐州地方，招募數萬名逃亡的人，讓他們建屋定居耕田，号稱闆升。
趙全等人尊奉俺答為帝王，替他築城池，造宮殿；同時修造自己的府第，儀禮宛如王者，将門題稱開化府。
他日夜教俺答練兵法。
由東面攻入薊、昌地區，向西劫掠忻、代地區，騎兵逼迫平陽、靈石，直到潞安以北。
從嘉靖辛醜(1541)開始，騷擾邊關達到三十年，邊防大臣因為失利而被治罪的人很多，邊患較陝西四鎮為重。
朝廷懸賞抓獲趙全的人封官都指揮使，賞白銀一千兩，最終沒有收獲。
邊關的将士都賄賂敵寇謀求和平，有人還替敵人效勞；那些落入敵手又自