高邦佐，字以道，襄陵人。萬曆二十三年(1595)進士，授壽光知縣。他在壽光教民墾荒，招集流亡百姓三千餘家。後曆任戶部主事、員外郎。在任永平知府時，疏浚灤河，修築長堤，裁制稅使高淮，使他不敢肆意橫行。後調任天津兵備副使，平息大盜董時耀。又轉任神木參政，多次擊破“套寇”沙計。母親去世，他歸家服喪，孝期滿，補任薊州道參政，因在調兵中違背主帥意圖，被罷官歸家。
天啟元年(1621)，清軍攻破遼陽，起任邦佐為參政，分守廣甯。熊廷弼與王化貞不合，邦佐因而預料遼東用兵必敗，多次請求準假歸養八十老母。剛被批準，化貞棄廣甯逃跑。守軍将士看到邦佐又已請假，軍無統帥，便打算撤回關内。邦佐厲聲阻止：“我一日不走，便是一日封疆之臣，你們要向哪裡走！”連夜寫信給母親，表示誓死保衛疆土。他趕到右屯去拜見熊廷弼，對他說：“廣甯城中雖亂，好在敵人還不知道，應盡快提兵入城，斬一二逃跑者，人心自定。如果公不去，請給我邦佐一支人馬去抵禦清軍。”廷弼沒有接受他的要求，而是同化貞一樣離開防地。邦佐仰天長歎，對随行人員說：“經略、巡撫都走了，大勢已去。松山是我的防守之地，與防地共存亡。你回去禀告太夫人。”解印自盡。仆人高永說：“主人死，怎能沒有仆從。”也自盡了。朝廷賜祭葬，贈光祿卿，再贈太仆卿，谥忠節。蔭後代為錦衣衛百戶，建祠宣武門外，與張铨、何廷魁一同祭祀。