安位于是派人奔赴鎮遠，向總督楊述中請求投降。
楊述中答應了他，讓他将奢崇明父子活捉獻來替自己贖罪，于是便主張對賊人一意招撫。
而王三善則責成安位将安邦彥一起抓來，主張對叛賊撫剿并用。
兩人意見不合，向朝廷上奏時往返之間已拖延了數個月，安邦彥得以添兵守備。
此後，王三善軍糧不繼，便焚燒了大方，退兵回貴州，途中與賊人相遇，王三善被害。
于是，安邦彥率數萬人馬前來追擊，總理魯欽奮力抵禦，大戰數日。
官軍糧盡，士兵乘夜逃走，魯欽自刎而死。
此後賊人對各堡燒殺搶劫，苗人土兵又幫助叛賊，使得貴陽城三十裡外的地方柴草不生，于是城内又大受震動。
當初，大方東倚播州，北靠蔺州，相互成犄角之勢。
後來播州、蔺州的叛亂平定之後，大方的叛賊隻好依賴烏撒的救援，而畢節又是四方夷人的交彙之所。
當王三善從貴陽府的陸廣深入到大方之地一百七十裡時，都是羅人的巢窟，因失地利所以失敗了。
天啟年間，朱燮元出任四川總督，建議雲南的官軍從沾益州出兵，遏制安效良的救援，并分兵占據天生橋、尋甸等地，切斷叛賊的退路；四川的官軍則兵臨畢節，扼守住交通要道，再出兵繞到龍場岩後面，占領天險之地；貴州的官軍從普定渡過思臘河，直接趕往安邦彥的老巢，經過陸廣、鴨池直搗叛賊的空虛之地；廣西的官軍從泗城出發，分路策應；最後朝廷大軍從遵義出發，浩浩蕩蕩敲鼓前進。
不久，朝廷以為該地的憂患已快平息，沒有用朱燮元的建議。
闵夢得繼任總督以後，亦認為貴州到大方之間的路途太險，叛賊隻倚恃畢節一條道路與外界相通，建議朝廷的官軍應從永甯開始，由永甯再到普市、再到摩泥，再到赤水，這一百五十裡路都較平坦。
赤水有城郭可資堅守，官軍應安營紮寨逐步進逼。
赤水過去四十裡是白岩，再過六十裡是層台，又過六十裡是畢節。
畢節到大方不到六十裡路，叛賊定會傾全力守禦。
官軍必須以重兵扼守該地，切斷叛賊四散逃跑的道路。
然後對遵義和貴陽限期進兵。
這個建議也沒有被采用。
等到貴州的事情弄得非常棘手了，皇帝才下诏書起用朱燮元總督貴州、雲南、四川、廣西的軍務。
這樣，朱燮元再次莅臨貴州時，已是崇祯元年(1628)了。
奢崇明自稱為大梁王，安邦彥自号為四裔大長老，其部下衆人都号稱為元帥。
他們合力向永甯進發，先侵犯赤水。
朱燮元授意赤水的守将佯裝敗北，誘敵深入。
朱燮元估計叛賊已抵達永甯時，分别派遣将領林兆鼎從三岔進兵，王國祯從陸廣進兵，劉養鲲從遵義進兵。
安邦彥分兵四應，力不能支。
羅乾象又出奇兵繞到安邦彥的背後襲擊，叛賊大驚而逃，奢崇明、安邦彥都授首被擒。
安邦彥作亂七年才被誅殺。
朱燮元便傳檄文給安位，赦免他的罪行，允許他歸附朝廷。
安位這個小子無法決定，他的手下人謀劃集合潰散之兵來拒官軍。
朱燮元扼守住要害之地，四面疊攻，斬獲敵人首級一萬多個。
同時，朱燮元還得到了向導，發掘敵人埋藏的粟米來吃，叛賊更加饑餓。
朱燮元還派人到大方燒毀叛賊的房屋，安位于是大為恐慌，率領手下的四十八人出來投降。
朱燮元上奏朝廷，請求允許安位等人投降，朝廷同意。
而以前幫助安邦彥作亂的前宣慰宋萬化的兒子宋嗣殷到此也被剿滅。
朝廷便在宋氏洪邊十二馬頭的地方設置了開州，修建城垣，設立官衙。
朱燮元又派兵平定了擺金等五洞的叛亂苗人。
這樣，水西的勢力就更孤弱了。
十年(1637)，安位死，沒有兒子繼嗣，其宗族的親屬争奪承襲權。
朝廷想乘其内亂之時在此地設置郡縣，廢除土司。
朱燮元上奏說不可驟然行此舉措，朝廷便傳檄文給當地的土目，将朝廷的天威和恩德谕告他們，當地苗人争相向朝廷納土獻印。
貴陽剛剛平定，而明朝不久也滅亡了。