到密诏，東邊部隊在君子館遭到失敗，并州全軍不許出戰，已經回到并州了。
當時遼兵遍山，齊賢說：“敵人隻知道潘美要來會師，而不知道潘美已退兵。
”于是把使者關閉在密室，半夜派出軍隊二百人，每人拿一面旗幟，背一束草，離州城西南三十裡，打出旗幟燃燒幹草。
遼兵遠遠看見火光有旗幟，以為是并州部隊到了，驚駭而逃走。
齊賢先在土磴砦埋下二千伏兵，襲擊大敗遼軍，擒俘遼軍北大王的兒子一人，帳前舍利一人，殺敵數百，俘獲二千匹戰馬及很多兵器。
捷報上奏，齊賢把功勞歸于漢斌貝。
端拱元年(988)冬天，授任工部侍郎。
遼兵又從大石路往南侵犯，齊賢預先選擇廂兵一千人分為二支，分别駐紮在繁..、崞縣。
下令說：“代西有敵人，則崞縣的部隊出戰，代東有敵人，則繁..的部隊出戰。
戰鬥發生後，則郡中部隊集合作戰。
”到此時，遼兵果然被繁..部隊打敗。
端拱二年，建立屯田制。
齊賢兼任河東制置方田都部署，入朝授任刑部侍郎、樞密副使。
淳化二年夏天，任參知政事。
幾個月後，授任吏部侍郎、同中書門下平章事。
齊賢的母親孫氏年紀有八十多歲，封為晉國太夫人，每次入宮朝見，太宗歎服她高壽，有好兒子，常常下手诏慰問，給與賞賜，朝官們都感到他家很榮幸。
當初，王延德與朱贻業一同掌管京城糧倉，想求任地方官，贻業與參政李沆是親家，就向李沆請托，李沆替他向齊賢請托，齊賢告訴了皇上。
太宗因為延德曾經奉事晉王府，厭惡他不自己陳述請求而委托執政大臣，召見并斥責了他。
延德、贻業都瞞着不說實情，齊賢不想連累李沆，單獨承擔責任。
淳化四年六月，罷前職任尚書左丞。
十月，命他知定州，齊賢因為母親年老不願去。
不久，遭母喪，水漿不入口者七天，從此每天隻吃一碗粥，守喪期間一直不吃酒肉蔬果。
不久轉任禮部尚書、知河南府，當時監獄有死犯将處決，齊賢到任後，馬上辨明案情而放了他。
三天後，改任知永興軍。
當時..門祗候趙贊因為議論政事得到皇帝寵幸，提點關中糧食，所做多豪橫不法。
齊賢論奏列舉他的罪狀，終于伏法。
不久改任知襄州，又改任知荊南，又改任知安州。
一年後，加任刑部尚書。
真宗即位，召他入朝授任兵部尚書、同中書門下平章事。
曾經向皇上從容講說帝王之道，而推究其所以然的根本，并且說“：我受陛下異常恩遇，所以加倍報答。
”真宗說：“我認為帝王之道無迹可循，隻要政事适當則近于帝王之道啊。
”當時他的親戚中有人因分财不均互相訴訟，又入宮告狀。
齊賢說：“這不是台府能決斷的，我請求自己處治。
”真宗表示同意。
齊賢坐在相府裡，召訴訟的人來問道“：你是認為他家分得多，你家分得少嗎？”回答說“：是。
”命他寫下名字。
于是召來兩個官吏，令甲家到乙家住宅，乙家到甲家住宅，财物不能移動，分書交易。
第二天上奏給皇上，皇上非常高興地說“：我本來知道非你不能決定。
”郊祀禮後，加任門下侍郎。
與李沆同事，不和。
因冬至日朝會時醉酒失儀，免去相位。
鹹平四