孔文仲字經父，臨江新喻人。
性情潔身自好，很少言笑。
年青時刻苦問學，号稱廣博洽聞。
考中進士，南省考官呂夏卿，稱贊他的詞賦清澹秀麗，策論深博，文章氣勢類似荀卿、揚雄，建議主管部門，拔為第一。
調任餘杭縣尉。
恬靜正直自守，不事請托求見。
轉運使在杭州，召他參與議事，議事完畢後，馬上回縣，不去州府。
有人問他，他說“：我在州府沒事。
”又轉任台州推官。
熙甯初年，翰林學士範鎮以制舉薦舉他，應對策論九千餘言，力論王安石所建立的理财、訓兵之法為不對，宋敏求列他為特等。
王安石發怒，告訴神宗，禦批罷歸原官。
齊恢、孫固封還禦批，韓維、陳薦、孫永都極力上言孔文仲不應黜退，五次上奏章，沒有得到同意。
範鎮又說：“孔文仲低賤疏遠，不知忌諱。
而且以直言求之，卻又怪罪他，恐怕為聖明之累。
”也不聽從。
蘇頌歎息說“：朝廷正求賢才如饑渴，有這樣的人才而不被錄用，豈不是議論太高遠而難以符合邪佞，言詞太偏激而取怨嗎？”
吳充為宰相，想要把孔文仲安排在館閣，又有人嫉妒，僅得國子直講。
求學的人正用王氏經義上進，孔文仲不研習王氏書，換為三班主簿，出任保德軍通判。
當時征伐西夏，幾十萬人都到邊境上，很久不解散，邊地人厭倦困苦，孔文仲陳述三不便說：“大部隊沒有出動，而丁夫預先集中；河東雇民夫，勞民傷财；各路出兵，首尾不