林寺藏經閣中盜得這部經書，被覺遠大師直追到華山之巅，眼看無法脫身，剛好身邊有隻蒼猿，兩人心生一計，便割開蒼猿肚腹，将經書藏在其中。
九陽真經的下落，成為武林中近百年來的大疑案。
後來潇湘子和伊克西帶同蒼猿，遠赴西域，兩人心中各有所忌，生怕對方先習成經中武功，害死自己，互相牽制，遲遲不敢取出猿腹中的經書，最後來到昆侖山的驚神峰上，伊湘兩人互施暗算，鬥了個兩敗俱傷。
這部修習内功的無上心法，從此留在蒼猿腹中。
潇湘子的武功本比伊克西稍勝一籌，但因他在華山絕頂打了覺遠大師一拳，由于反震之力，身受重傷，因之後來與伊克西相鬥時反而先行斃命。
伊克西臨死時遇見“昆侖三聖”何足道，良心不安，請他赴少林寺告知覺遠大師，那部經書是在這頭蒼猿的腹中。
但他說話之時神智迷糊，口齒不清，他說“經在猴中”，何足道卻聽做什麼“金在油中”。
何足道信守然諾，果然遠赴中原，将這句“金在油中”的話跟覺遠大師說了。
覺遠無法領會其中之意，固不待言，反而惹起一場絕大的風波，武林中從此多了武當、峨嵋兩派。
至于那頭蒼猿卻甚是幸運，在昆侖山中取鮮桃為食，得天地之靈氣，過了90餘年，仍是縱跳如飛，全身黑黝黝的長毛也盡轉皓白，變成了一頭白猿。
隻是那部經書藏在腹中，逼住腸胃，不免時時肚痛，肚上的疔瘡也時好時發，直到張無忌給它取出，就這白猿而言，真是去了一個心腹大患。
張無忌從猿腹中得到《九陽真經》，想到張三豐曾說過若習得少林、武當、峨嵋三派的九陽神功，或能驅去體内的陰毒。
這三派九陽功都脫胎于九陽真經，張無忌被困谷中左右也無别事，便照書修習。
張無忌既被囚禁在這四周陡峰環繞的山谷之中，便算真從經中習得神功，驅去陰毒，總是不能出去，心想就算練不成，總也是打發了無聊的日子。
隻短短四個月時光，便已将第一卷經書上所載的功夫盡數參詳領悟，依法練成。
練完第一卷經書後，屈指算來，胡青牛預計他毒發斃命之期早已過去，可是他身輕體健，但覺全身真氣流動，全無病象，連以前時時發作的寒毒侵襲，也要時隔一月以上才偶有所感，而發作時也極輕微，知“九陽真經”便是張三豐念念不忘的真經寶典，欣喜之餘，參習更勤。
待得練到第二卷經書的一小半，體内陰毒已被驅得無影無蹤了。
張無忌練完第二卷經書，便已不畏寒暑。
隻是越練到後來，越是艱深奧妙，進展也就越慢，第三卷整整花了一年時光，最後一卷更練了三年多，方始功行圓滿。
張無忌後來被說不得裝入乾坤一氣袋中，大布袋内真氣充沛，等于數十位高手各出真力，同時按摩擠逼他周身數百處穴道，他内内外外的真氣激蕩，身上數十處玄關一一沖破，隻覺全身脈絡之中，有如一條條水銀在到處流轉，舒适無比；便在這頃刻之間，張無忌所練的九陽神功已然大功告成，水火相濟，龍虎交會，破袋而出。
這等機緣自來無人能遇，而這寶袋一碎，此後也再無人有此巧遇。