轼辭别家人上路的時候，湖州太守衙門的人都吓得不知所措，個個躲躲閃閃，倒是老百姓都出來看太守啟程。
後來據蘇轼回憶，說皇差逮捕太守猶如捕盜。
有人說蘇轼在赴京途中曾想自殺，在揚州渡江時，就有過跳江自盡的念頭。
他不知道自己要判什麼罪，并且擔心案子會牽涉到很多朋友，而且還會牽涉到弟弟蘇轍，因為蘇轍提前給他通風報信。
思之再三，他終于打消了自殺的念頭，平安地到達京城。
蘇轼進京後，被關進了禦史台的皇家監獄。
3、審訊
蘇轼七月底被拘捕，八月十八日被關進禦史台的皇家監獄。
蘇轼被關進大牢後，一方面，要随時接受訊問，另一方面，要他自己交待問題。
禦史們也沒有閑着，他們到處搜集蘇轼的犯罪證據。
到九月份，從四面八方抄獲蘇轼寄贈他人的詩詞一百多首，在審問時呈閱，受牽連的有三十九人，無論哪首詩，隻要有疑問，蘇轼都得作出解釋。
蘇轼對大部分指控都供認不諱，承認在詩中批評新政。
蘇轼在受審期間，也有很多人仗義相救。
宰相吳充上表，說陛下以堯舜為榜樣，輕視魏武帝曹操。
曹操雖然疑心重，但卻能容忍祢衡，陛下難道就容不下一個蘇轼嗎？
同修起居注王安禮也替蘇轼解辯，他說，自古以來，寬仁大度的主子是不會以言語來懲罰人的，蘇轼是一個滿腹經綸的飽學之士，認為自己可以成就一番事業，如今卻碌碌如此，不免有些失望和怨憤，吟風詠月，發發牢騷，也是很正常的事情。
因為作了幾首詩而獲罪入獄，甚至殺頭，恐怕後世的人會說陛下容不得人才。
王安石與蘇轼政見不同，蘇轼就是因為反對王安石變法而被貶出京城。
當他聽說蘇轼獲罪入獄之後，竟然也上書趙顼，說聖朝不宜誅殺名士。
可見，王安石是個君子，隻可惜他所重用的人都是一些小人。
蘇轼坐牢的時候，曾發生了一件有趣的事情。
蘇轼坐牢，他的兒子蘇邁每天去給父親送牢飯。
由于父子不能見面，他們暗中約定，平時隻送蔬菜和肉食，如果有死刑判決的壞消息就改送魚，以便早做心理準備。
有一天，蘇邁有事，不能前去送飯，便委托一個朋友幫他送牢飯，但他忘了告訴那個朋友與父親約定的暗号。
恰巧那位朋友做了一盤紅燒魚。
蘇轼一見，大吃一驚，以為自己難逃一死，悲憤之下，寫了兩首絕命詩給弟弟蘇轍：
聖主如天萬物春，小臣愚暗自忘身。
百年未滿先償債，十口無歸我累人。
是處青山可藏骨，他年夜雨獨傷神。
與君世世為兄弟，更結來生未了因。
柏台霜氣夜凄凄，風運琅珰月向低。
夢繞雲山心似鹿，魂飛湯火命如雞。
眼中犀角真君子，身後年衣愧老妻。
百歲神遊定何處，桐鄉知葬浙江西。
蘇轼在首詩中說得非常悲慘，說他死了之後，一家十口全賴弟弟照顧，自己的孤魂野鬼獨卧荒山聽雨泣風号。
他表示與蘇轍世世為兄弟。
并在詩裡表示皇恩浩蕩，自己受恩已多，無法感恩圖報，實在慚愧。
又說這次别無所怨，都是自己之過。
蘇轍接到哥哥的絕命詩，伏案而泣，悲恸欲絕。
他立即向皇帝上書，希望能以自己的官爵贖其兄之罪。
4、貶谪
蘇轼關押受審的事在朝中鬧得沸沸揚揚，宮中的太皇太後曹氏也知道了這件事。
這一天，太皇太後病了，趙顼進宮問安。
太皇太後關心地問起了蘇轼的事，她問趙顼：
“聽說蘇轼被诏逮關進牢裡，交禦史台訊問，蘇轼究竟是犯了什麼罪案？”
趙顼回答說：“蘇轼怨望朝廷，毀謗君父，犯着大不敬的罪名。
”
太皇太後驚道：“果然嗎？蘇轼何至于此呢？有證據嗎？”