神宗範天合道哲肅敦簡光文章武安仁止孝顯皇帝，叫朱翊鈞，穆宗第三子。
其母為李貴妃。
隆慶二年(1568)，被立為皇太子，當時年方六歲。
翊鈞少年聰慧，穆宗曾馳馬宮中，他進谏道：“陛下為天下之主，獨騎而騁，甯無銜橛憂。
”穆宗大喜，下馬大加撫慰。
陳皇後病居别宮，翊鈞每晨随母前往探問，皇後每聽到腳步聲就高興起來，并掙紮着坐起，取出經書考問他，翊鈞總是高聲回答，其母李貴妃也十分高興，兩宮因此而越來越和睦。
隆慶六年(1572)五月，穆宗駕崩。
六月初一，日食。
初十，朱翊鈞繼承皇帝之位。
定第二年為萬曆元年，頒诏大赦天下。
在鄉間祭祀建文朝盡節諸臣，有子孫後代的加以恤錄。
十六日，罷免高拱。
二十三日，高儀死去。
二十八日，禮部尚書呂調陽兼任文淵閣大學士，參預機要事務。
秋七月初四，漕運初通至密雲。
初七，考察京師官員。
十五日，告誡朝廷諸臣“：近年來，士習慣于澆薄，為官之禮法被削弱，誣蔑老成為無用，驕狂者便佞為有才。
于是使朝廷賦予的權力，僅僅成為人臣報複的資本。
雖需要加以懲戒，但我都予以寬恕。
諸臣應力改前過，共維新政。
若仍沉溺于故習，背公徇私，獲罪于祖宗，朕不敢赦免。
”十七日，尊稱陳皇後為仁聖皇太後，李貴妃為慈聖皇太後。
八月初五，祭祀大社大稷。
九月十一日，将莊皇帝安葬于昭陵。
冬十月初六，侍郎王遴、吳百朋、汪道昆分别巡視邊防。
初八，中止行刑。
十一月十三日，河工完成。
十二月初九，赈濟榆林、延綏饑荒。
二十二日，以穆宗駕崩不久為由，下诏免設元夕燈火及宮中宴席。
萬曆元年(1573)春二月初二日，聽取經筵講解。
三月十六日，诏令内外官員舉薦将材。
夏四月十六日，潮、惠賊寇被平定。
二十一日，天大旱，谕百官修身反省。
五月初五，诏令内外官員慎重進行刑獄之事。
六月二十四日，赈濟淮安水災。
秋七月，黃河在徐州決口。
九月初六，赈濟荊州、承天及濟南災害。
初九，四川都掌蠻被平定。
二十六日，中止行刑。
冬十一月初四，朱翊鈞诏令諸司訂立章程限制文書上報時間，以防延遲緩慢。
十二月十三日，赈濟遼東饑荒。
萬曆二年(1574)春正月十八日，朱翊鈞在皇極門召見朝觐廉能之官。
二月初九，赈濟四川被賊寇侵擾諸縣。
三月十八日，賜予孫繼臯等人進士及第以及其他不同的出身。
夏四月二十二日，朱翊鈞诏谕百官行久任之法。
五月二十八日，穆宗牌位附于太廟。
八月二十八日，赈濟山西災害。
二十九日，赈濟淮、揚、徐水災。
冬十月十三日，審理囚犯。
二十六日，上朝辦公審閱選官制度。
閏十二月二十日，下诏免去第二年元夕燈火。
當年，琉球前來朝貢。
萬曆三年(1575)春正月初七，祭獻太廟。
二月初九，祭祀大社大稷。
十二日，诏令南京職務應精簡為宜，官吏不得虛占其位以充數。
二十七日，開始命日講官分别記注起居，纂輯章奏，臨朝值班。
夏四月初一，日食，為日全食。
初四，翊鈞書寫謹天戒、任賢能、親賢臣、遠嬖佞、明賞罰、謹出入、慎起居、節飲食、收放心、存敬畏、納忠言、節财用十二事置于座右側，以期自警。
五月初三，淮、揚發生大水災，于是他诏令審察二府官吏，罷免了有貪污等老毛病的官員。
六月初一，浙江海潮泛濫。
十一日，命撫、按官員，官吏是否賢能一并舉薦和彈劾，不得偏重甲科進士。
當年夏天，蘇、松、常、鎮普發大水。
秋八月十一日，禮部侍郎張四維被升為禮部尚書兼任東閣大學士，參與機要事務。
十二日，黃河在高郵、砀山決口。
二十三日，朝廷免除淮、揚、鳳、徐等發生水災之地的田租。
九月二十三日，京師發生地震。
冬十月初三，京師再次地震，命群臣修身反省。
初四，中止行刑。
十一月十一日，朱翊鈞在京城南郊祭天。
十二月初七，朱翊鈞又诏谕免去第二年元夕燈火。
這一年，有安南、琉球、暹羅、土魯番前來朝貢。
萬曆四年(1576)春正月二十三日，遼東巡按禦史劉台因談論張居正被逮捕入獄，削除官籍。
夏五月十六日，祭祀地于北郊。
六月十九日，又遣内臣監督蘇、杭織造。
秋七月初六，朱翊鈞诏谕吏、戶二部清理吏治，并分别免除所欠賦稅，折十分之三成收取明年漕運糧。
十一日，又派遣禦史督修江、浙水利。
十三日，興修泗州祖陵。
二十日，完成草灣黃河工程。
八月初二，祭奠先師孔子。
當年秋天，黃河在崔鎮決口。
冬十月十四日，赈濟徐州及豐、沛、睢甯、金鄉、魚台、單、曹七縣水災，免除不同數量的田租。
這一年，有安南、琉球、烏斯藏、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密前來朝貢。
萬曆五年(1577)春正月二十一日，朱翊鈞诏令鳳陽、淮安大力号召墾田。
二月初七，赈濟廣西饑荒。
三月十八日，賜予沈懋學等為進士及第以及其他不同的出身。
夏五月初六，廣東羅旁瑤被平定。
秋八月初八，黃河又在崔鎮決口。
閏八月初一，日食，因陰雲而未見。
九月初二，重新起用張居正。
冬十月二十二日，因談論張居正因父喪事而穿素服辦公、不參加吉禮一事，編修吳中行、檢讨趙三賢、員外郎艾穆、主事沈思孝等皆受杖刑，并分别被罷免和廢黜，甚至遭到貶谪和戍邊。
二十四日，進士鄒元标被杖擊，進而将其戍邊。
十一月初一，朝廷以星位變化考察百官。
當年，有琉球前來朝貢。
萬曆六年(1578)春正月，朝廷征集民工修築黃河缺口堤岸。
二月十七日，免除兖、青、登、萊所轄地區的拖欠賦稅。
十九日，冊立王氏為皇後。
三月初三，禮部尚書馬自強兼任文淵閣大學士，吏部侍郎申時行兼任東閣大學士，參與機要事務。
十三日，張居正因安葬父親而還鄉。
夏四月十四日，免除湖廣、四川所欠的賦稅。
二十五日，朱翊鈞诏谕戶部每年增收金花銀二十萬兩。
六月十五日，張居正回京師。
秋七月初六，呂調陽辭官。
二十七日，朝廷诏谕江北各府百姓，十五歲以上而無田者，官府供給其一頭牛和五十畝田，開墾三年後開始征收賦稅。
九月二十二日，又诏谕蘇州諸府開墾荒田，六年之後起科。
二十三日，中止行刑。
冬十月十四日，馬自強死去。
十一月十四日，祭祀天于南郊。
這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬曆七年(1579)春正月二十二日，朱翊鈞下诏搗毀天下書院。
二月十四日，派人分頭巡視邊防。
三月十九日，朝廷免除淮、揚拖欠賦稅。
夏五月十九日，祭祀地于北郊。
六月十七日，核查兩畿、山東、陝西等地勳官、皇戚的田賦。
秋七月初八，赈濟蘇、松水災，免除其稅糧。
十四日，京師發生地震。
這一年，有烏斯藏前來朝貢。
萬曆八年(1580)春二月初一，有日食。
十八日，耕種謖田。
二十八日，完成黃河決口工程。
三月十二日，侍奉兩宮皇太後到天壽山谒陵，免除所過地方的田租。
十五日，回宮。
二十八日，賜予張懋修等人為進士及第以及其他不同的出身。
夏閏四月二十二日，官軍平定廣西八寨賊寇。
冬十月初五，淘汰宮内宮外冗官。
初九，赈濟蘇、松、常、鎮饑荒。
十一月初十，下诏丈量百姓田地。
這年，有琉球前來朝貢。
萬曆九年(1581)春正月初五，诏令邊臣備警。
初六，裁減諸司冗員。
初八，土蠻進犯錦州，遊擊周之望敗死。
十四日，朱翊鈞诏命翰林官每天四人入閣供職。
十六日，裁減南京冗官。
十九日，遼東總兵官李成梁在襖郎兔擊敗土蠻。
三月初三，隆重檢閱軍隊。
當月，土蠻進犯遼陽，副總兵曹..領兵抵抗，戰敗。
夏四月初四，赈濟山西發生災害的州縣。
二十二日，赈濟蘇、松、淮、鳳、徐、宿災害。
戶部呈上《萬曆會計錄》。
秋八月十六日，揚州發大水。
九月二十六日，中止行刑。
冬十月初八，土蠻進犯廣甯、義州，李成梁将其擊退。
十一月二十六日，赈濟真定、順德、廣平災害，免除稅糧。
當年，裁減各省冗官，核查徭役賦稅，淘汰諸司冒濫冗費。
有琉球、安南、土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、烏斯藏前來朝貢。
萬曆十年(1582)春二月初四，順義王俺答死去。
初八，免去天下曆年拖欠的賦稅。
三月初二，杭州發生兵變，巡撫吳善言被抓。
初九，兵部侍郎張佳胤巡撫浙江讨伐叛軍，繼而予以平定。
十八日，泰甯衛部長速把亥進犯義州，李成梁