方國珍，黃岩人。
身材高大，面色黝黑，體白如瓠，力賽奔馬。
世代以行船海上販鹽為業。
元至正八年(1348)，有一個名叫蔡亂頭的人，在海上打劫财物，官府派兵追捕他。
方國珍的仇家便告發他通寇，方國珍殺死仇家，與其兄方國璋、其弟方國瑛、方國珉逃亡海上，聚集數千人，搶劫過往船隻，阻塞海路。
行省參政朵兒隻班率軍征讨，兵敗，被方國珍所捉。
方國珍迫使其請命于朝廷，授他為定海尉，不久反叛，侵犯溫州。
元朝以孛羅帖木兒為行省左丞，督軍前往征讨，也兵敗被捉。
元朝隻得派大司農達識帖睦迩再次招降他。
不久，汝、颍之地兵起，元朝招募水師防守長江。
方國珍心中疑懼，重新反叛，誘殺台州路達魯花赤泰不華，逃亡入海。
後來派人潛至京城，賄賂朝中權貴，允許他投降，授為徽州路治中。
方國珍拒不聽命，率軍攻陷台州，焚燒蘇之太倉。
元朝又以海道漕運萬戶之職招降他，方國珍這才投降，并接受這一官職。
不久進升行省參政，派兵進攻張士誠，張士誠派遣将領在昆山抵禦。
方國珍七戰七捷，直到張士誠也投降，才停戰退兵。
在此之前，天下太平，方國珍兄弟帶頭騷亂海上，官府憚于用兵，一意進行招撫。
隻有都事劉基認為方國珍是首逆，而且屢降屢叛，不可饒恕，但朝議時沒有聽從他的意見。
方國珍授官之後，據有慶元、溫、台之地，更加強大，不可控制。
方國珍開始作亂時，元朝發出空名宣诏數十道，招募人們去進攻賊寇，許多海濱壯士響應招募，并為此立功，可是負責此事的官員接受重賄，總是不給這些人應有的賞賜，有一家為此死去幾個人，卻得不到官職。
但對方國珍之徒，卻一再招撫，都升為大官。
因為這樣，百姓都羨慕當強盜，跟随方國珍的人日益增多。
元朝失去江、淮後，隻得憑借方國珍的船隻使海運暢通，便又以官爵籠絡他，這樣海運無事。
有一個名叫張子善的人，喜愛縱橫之術，勸說方國珍率軍溯江而上，窺視江東，北奪青、徐、遼海。
方國珍回答說“：我還沒有這麼大的志向。
”然後謝之離去。
朱元璋攻取婺州後，派主簿蔡元剛出使慶元。
方國珍與其下屬商量道“：江左号令嚴明，恐怕不能與他對抗。
況且與我為敵的，西有吳，南有閩。
不如暫且表示順從，借此作為聲援以觀其變。
”下屬覺得他說的在理。
于是，方國珍派使者給朱元璋送信，并奉獻黃