并不是很困難的事。
”皇上覺得十分有理，于是就命令方孝孺草拟诏書，派大理寺少卿薛岩飛馬馳送诏書到燕，完全赦免燕的反叛之罪，要求他們收兵回歸藩地。
又給薛岩帶上皇上數千言的手谕，讓他帶到燕王的軍隊中，秘密散發到将士手中。
但事到臨頭，薛岩隐藏宣谕不敢取出，燕王也不遵奉皇帝的诏令。
五月，吳傑、平安、盛庸帶兵騷擾燕軍的糧道。
燕王再次派遣指揮武勝上書請求皇上罷前線軍隊。
皇帝準備同意撤兵。
但方孝孺說：“撤兵容易，再次集聚軍隊就難了，不要被燕王的言語所迷惑。
”皇帝于是下令殺了武勝，以此來斷絕和燕國的交往。
沒多久，燕軍侵掠沛縣，并燒毀糧船。
當時黃河以北的軍隊疲累而無戰功，而德州的運糧道路又被截斷。
為此，孝孺深感憂慮。
燕世子仁厚，他的弟弟高煦狡詐，得寵于燕王，曾想争奪嫡長子之位。
方孝孺想用計挑起他們内亂。
于是方孝孺向建文帝禀明計劃，并派錦衣衛千戶張安帶着蓋有皇帝印章的書信，賜封燕世子。
世子拿到信函并不拆封，并将張安一起送到燕王軍帳裡。
于是離間之計失敗了。
第二年五月，燕軍打到了長江以北，皇帝下诏書征集全國的軍隊。
方孝孺說“：事情已經十分緊急。
可派人前往說和，許以割地，争取拖延幾天時間。
東南募兵已逐漸雲集，北方的軍隊不擅長水戰，如果兩軍在長江上決戰，勝負就難以預料了。
”建文帝派慶成郡主前往燕軍中，陳說了孝孺的意思。
但是，燕王不聽。
建文皇帝命令衆将率水師彙集在長江上，但明戰将陳蠧率領戰艦向燕軍投降了。
燕軍于是渡過了長江，當時是六月三日。
建文帝憂慮懼怕，有的勸說皇上移宮他處，再圖複興大業。
方孝孺力請皇上堅守京城等待援兵的到來。
即使失敗，也是為社稷而亡。
十三日，京城的金川門被打開了，燕軍入城，建文帝自焚而死。
當日，方孝孺被抓進監獄。
這以前，成祖發兵北平，姚廣孝向成祖請托方孝孺時說：“兵臨城下那一天，孝孺一定不會投降，請不要殺他。
如果殺了方孝孺，就會斷絕天下的讀書人。
”成祖點頭答應。
攻下南京後，想讓方孝孺草拟诏書。
方孝孺被召到宮殿後，悲恸之聲響徹大殿。
成祖從殿座走到方孝孺的身邊安慰他說“：先生不要自己苦自己，我不過是效法周公輔佐成王罷了。
”方孝孺問：