石邦憲，字希尹，貴州清平衛人。
嘉靖七年(1528)承襲世職為指揮使。
累功，晉官署都指揮佥事，充任銅仁參将。
苗人龍許保、吳黑苗反叛，總督張嶽提議征讨他們，而敵賊攻陷印江、石阡，石邦憲被坐罪逮問。
張嶽因為銅仁是敵賊的巢穴，而石邦憲有勇有謀，于是上奏留用石邦憲。
石邦憲于是與川、湖之兵共進貴州，攻破苗砦十分之五。
躲藏在山中竹林子裡的人，被搜殺殆盡。
上功，石邦憲居第一。
未及叙功，而龍許保等人突入到思州，捉住知府李允簡而去。
石邦憲緊急半路攔擊，将李允簡奪回來了。
石邦憲被停止俸祿，讓他戴罪立功。
敵賊攻破思州後，又糾集餘黨，與湖廣蠟爾山苗人會合，想攻石阡。
沒有攻克，經過省溪而回去。
千戶安大朝等人半路攔擊他們，俘殲敵人大半，奪下敵賊的全部辎重，敵人潰不成軍。
石邦憲于是讓使者重金收買老..、老亻革等人擒住龍許保送到軍門，而黑苗如過去一樣躲藏。
又用計重金收買烏朗土官田興邦等人斬黑苗，敵賊于是被平定。
石邦憲于是晉為署都督佥事，充任總兵官，代沈希儀鎮守貴州。
台黎砦苗人關保倡導作亂，四川容山、廣西洪江諸苗響應。
遠近騷然，朝廷上是安撫還是剿殲不能定下來。
石邦憲與湖廣分兵讨破他們，傳檄十八砦，許他們捉拿首惡贖罪。
諸苗聽從安撫，設盟受約而回去。
播州宣慰楊烈殺長官王黼，王黼的同黨李保等人治兵相攻快有十年，總督馮嶽與石邦憲讨平他們。
真州苗人盧阿項作亂，石邦憲用兵七千人編筏渡江，直抵磨子崖。
估計敵賊必定來進行夜襲，預先防備。
敵賊到達後，被他們擊敗。
敵賊向播州吳鲲求援。
諸将感到恐懼，石邦憲說：“水西宣慰安萬铨，是播州所畏怕的。
我調水西之兵攻烏江，聲讨楊烈縱吳鲲助叛逆之罪，楊烈哪有空暇救人呢？”之後，水西之兵到達。
石邦憲進逼敵人的巢穴，乘風放火，斬關而登，敵賊大崩潰，擒住敵賊首領父子，殲俘四百七十多人。
石邦憲晉署都督同知。
石邦憲攻破地隆阡叛苗四砦，又攻破答千諸砦，擒住他們的巨魁。
地隆阡派遣敵賊龍老三、龍得奎勾結龍停苗人老夭、扳凳苗人石章保等人縱兵搶掠，捉拿石耶洞土官的妻子冉氏帶回去，攻擊梅平砦。
官軍要擒拿龍老三。
龍得奎走脫幸免，又與老夭等人攻破平南營囤。
石邦