三千騎兵，在安銀堡大敗敵人。
李文進向朝廷推薦了俞大猷的這一戰車禦敵之法，朝廷因此設置了兵車營。
京師營衛中有兵車營這一編制，從此時開始。
李文進準備偷襲蒙古部落，就商于俞大猷，依計行事，果然大有戰績。
朝廷因此賜還俞大猷世代蔭庇子孫的特權，接着敵人攻掠廣武，俞大猷又将其擊退。
此前在評定平息汪直倭患的功勞時，朝廷同意将俞大猷免罪錄用。
至此，鎮..出現匪情，川湖總督黃光升向朝廷推薦了俞大猷，俞大猷即任命為鎮..參将。
廣東饒平賊人張琏，數次攻陷城邑，多年沒有平定。
嘉靖四十年(1561)七月，皇帝下诏調俞大猷去南贛，集合福建、廣東兵力讨伐。
這時胡宗憲兼管江西，他知道張琏遠離巢穴，要俞大猷迅速追擊。
俞大猷說“：應以奇兵偷襲他的巢穴，攻擊他必須救護的要害，怎麼可以用數萬人的部隊跟着張琏一人到處流動呢？”于是迅速帶一萬五千人登上柏高嶺，俯視盜賊營地。
張琏果然回來救援，俞大猷連敗張琏，斬敵一千二百餘人。
盜賊恐懼，守營不出。
俞大猷用計誘張琏出戰，派人從陣後将其擒獲，還擒獲另一頭目蕭雪峰。
廣東人将功據為己有，俞大猷亦不計較。
俞大猷遣散張琏餘部二萬人，沒有殺戮一個。
俞大猷升為副總兵，協助駐守南、贛、汀、漳、惠、潮諸郡。
又乘勝征讨程鄉的盜賊，梁甯逃走，徐東洲被擒獲。
林朝曦約請黃積山謀求大舉抗拒官軍，官軍攻破賊營，斬了黃積山，林朝曦逃去，但後來也被徐甫宰所擊滅。
不久俞大猷升為福建總兵官，與戚繼光一道攻下興化城，共同擊敗海上倭寇。
事迹詳載于戚繼光傳。
由于戚繼光率先破城，得到最高獎賞，俞大猷僅被賜給銀币而已。
嘉靖四十二年(1563)十月俞大猷調任南贛。
四十三年改任廣東。
當時潮州倭寇二萬人與大盜吳平相互支撐，而藍松三、伍端、溫七、葉丹樓等人則經常在惠州、潮州一帶劫掠。
福建則有程紹祿禍亂延平，梁道輝騷擾汀州。
俞大猷以自己的威名震懾這些為非作歹者，他單騎闖入程紹祿駐地，督促程紹祿回到山寨，并要程紹祿将梁道輝趕回去。
程、梁二人最後被另一支官軍消滅，惠州參将謝敕與伍端、溫七作戰失利，謝以“俞家軍”來了恐吓對方，伍端聽說，趕忙帶着一幫山寨的酋長回去了。
不久，俞大猷果真來到惠州，擒獲溫七。
伍端自己負荊請罪，請上陣殺倭以彌補自己的過失。
俞大猷以伍端部衆為先鋒，官軍随後，在鄒塘包圍了倭寇，一晝夜連破三處倭寇巢穴，焚死、斬殺倭寇四百多人，又在海豐大敗倭寇，倭寇全部逃到崎沙、甲子等處，搶奪漁民船隻向大海方向逃去。
倭寇船隻在海中多遇風沉沒。
僥幸脫險的二千多人，退守海豐金錫都。
俞大猷将其圍困達兩月之久，倭寇糧盡，意欲逃去。
副将湯克寬設兵伏擊，親自殺死倭之悍将三人。
參将王诏等人随後趕到，倭寇遂被擊潰。
于是移師潮州，依次降伏藍松三、葉丹樓。
并派人招降吳平，将吳平安置在梅嶺。
不久吳平又舉兵反叛，建造戰船數百艘，聚集部衆一萬多人，築起三座城池固守，經常在濱海地區劫掠。
福建總兵官戚繼光攻擊了吳平，吳平逃往南澳。
四十四年(1565)秋天，