庫日益充實，但是豪強和狡猾的官民都怨恨居正。
居正的服喪期将結束，皇帝召見吏部官員詢問日期，敕令賞賜他白玉帶、大紅色坐蟒官服、盤蟒官服。
皇帝在平台召見他，慰撫很久。
派宦官張宏引導他拜見慈慶、慈甯兩宮皇太後，她們都有恩賜給他，而且慈聖皇太後還加賜九品禦膳，派張宏侍奉居正宴享。
皇帝即位初期，馮保早晚巡視皇帝的起居，用力擁抱提拿，皇帝稍有冒犯，馬上報告慈聖皇太後。
慈聖皇太後管教皇帝很嚴格，每次責備他，就說“：假使張先生知道了，會怎麼樣？”因此皇帝很害怕居正。
等到皇帝逐漸長大，心中就開始厭煩。
乾清宮小宦官孫海、客用等人引導皇帝遊玩戲耍，都被皇帝寵愛。
慈聖皇太後派馮保把孫海、客用抓起來，杖責後驅逐了他們。
居正又逐條列舉這些小内侍的罪惡，請求貶逐他們，指令司禮和内侍們自己陳述，皇帝裁定他們的去留。
張居正還趁機勸告皇帝戒除遊玩和宴樂重視起居，精神專注以便增添聖上的後代，節制賞賜以便減少浪費，拒絕珍玩以便養成好習尚，親理國事以了解政治事務，勤奮學習以便資助治理朝政。
皇帝受太後的逼迫，沒辦法，都答複可以，但是内心很恨馮保和張居正。
皇帝剛開始主持朝政，居正曾編纂古代治亂的事例一百多條，繪有圖畫，用通俗的話進行解釋，讓皇帝容易理解。
現在，又囑咐儒臣記錄太祖列聖的《寶訓》、《實錄》，分類編成書，共有四十條例：創業艱難，勵精圖治，勤奮學習，崇敬上天，效法先祖，保護百姓，謹慎祭祀，崇尚孝敬，開創好風尚，注意起居，戒除遊蕩，端正皇後和妃子的住處，教育太子，和睦宗族、藩國，親近賢臣，遠離奸邪的人，接受勸告，治理财産，遵守法律，告誡禁忌，辦實事，端正綱紀，審察官吏，固定職位，加重地方太守縣令的職權，駕馭親幸的人，正确對待外戚，重視農業，提倡教化，明确賞罰，講求诏書和命令的信用，慎重處理名分，裁減貢物和獻祭，慎重地賞賜，敦促節儉，刑罰和獄審要慎重，表彰功德，摒棄異端，整頓武備，防禦北方少數民族。
其中的話語很警誡人，張居正請求在皇帝讀經的空暇為他講解。
并奏請設置皇帝起居注，記錄皇帝的言行和朝廷内外的事情，每天派四名翰林官負責，及時著文做詩，準備皇帝顧問。
皇帝都用最高級别的诏令頒行。
張居正自從違反守喪禮制後，更加偏激放縱。
大多數因為自己的愛憎，對官員進行罷免或晉升。
他左右辦事的人大都通曉賄賂活動。
馮保的門客徐爵被提拔為錦衣衛指揮同知，負責南鎮撫司事。
張居正的三個兒子都在科舉考試中列為上等。
仆隸出身的遊七出錢買官，有功勞的皇族親戚和文武大臣很多人同他交往，締結姻親。
遊七衣冠整齊地拜見張居正，被列入士大夫中。
世人因此更加厭惡張居正。
沒多久，張居正患病。
皇帝頻繁地頒發聖旨詢問他的病情，拿出很多銀兩和絲帛給他做醫藥費。
經過四個月沒好轉，朝廷衆臣一齊齋戒替他祈禱。
南都、秦、晉、楚、豫的大官吏，沒有不建造祭壇的。
皇帝指令張四維等人處理内閣中細微的事務，大事情立即趕到張居正家中請他定奪。
居正起初自己處理，後來很疲憊不能全部審閱，卻不讓張四維等人摻和。
等到病情加重，請求辭官回鄉。
皇帝又頒布最高級别的诏書安慰、挽留他，稱他為“太師張太嶽先生”。
張居正考慮到自己不能康複，推薦以前禮部尚書潘晟和尚書梁夢龍，侍郎餘有丁、許國、陳經邦。
不久，又推薦尚書徐學谟、曾省吾、張學顔，侍郎王篆等人可以擔當大任。
皇帝将張居正的推薦書貼在内宮屏風。
潘晟、馮保接受别人的請托，強迫要張居正推薦。
當時居正已經很昏聩，不能自主。
等到他死去，皇帝因他而中止朝見，下诏以九壇進行祭祀，把他看成國公兼師傅。
居正先因六年考績滿，特别加封中極殿大學士；滿九年考績，賞賜他坐蟒官服，加封左柱國，蔭庇一個兒子為尚寶丞；因為皇