的指示，假如想免罪，應該怎麼解釋？”與高拱相抵觸，被貶出京城任陝西參政。
他再次上疏請求退休回家。
萬曆初年，晉升為太仆少卿。
又因病回鄉。
後由南京大理卿召至京都擔任刑部左侍郎。
平定了雲南、緬甸的亂賊，皇帝駕臨于午門樓察看俘虜。
舒化宣讀奏詞，聲音洪亮，抑揚頓挫，皇帝的目光盯着他。
遇上刑部尚書空缺，皇帝親拟诏令錄用舒化。
舒化上奏稱：“陛下的仁慈出自天性。
知府錢若赓、知州方複乾因為酷刑而死于戍邊。
請求申命大小臣僚，讓他們各自遵守律法條例，不要濫施酷刑。
《大明律》一書，高皇帝在兩廂房中閱覽，親手更改、審定。
現在還沒有經過詳細審議的案子就命令從重治罪，已經審定了的案子又下诏指令加罪而後斬殺，這就是說律法不值得為根據。
去年冬天不時下雨下雪，災異頻繁出現，過錯就在此處。
”皇帝下優诏答複他。
遇上續修《會典》，于是他編輯了嘉靖三十四年(1555)以後事例與刑法名稱相關的案子三百八十二條，上奏皇帝。
皇帝下诏将它告示朝廷内外。
萬曆十四年(1586)他響應诏令上奏陳述。
請求皇帝講求诏令的信用，使獄案訴訟清廉，迅速審訊定罪，嚴格檢驗，禁止冤屈和濫施刑罰，而以恪守天條、安撫百姓、回歸本源的聖心。
皇帝接納并嘉獎了他。
皇帝顧慮手下的大臣進行欺騙，間或有人揭發，就派遣官吏去加以逮捕，搜取證據，文書累疊積壓。
舒化稱：“主上治政法則貴在抓住綱要，不應當侵擾有司；徒然使人将過失歸咎于皇上，而下屬反而借機掩飾過失。
”潞王府的小校因事被兵馬司吏目鞭笞，皇帝惱怒，将吏目逮捕，投入诏獄，拷打緻死，又将七名捕卒治罪。
舒化為此争辯。
皇帝下诏将為首的一人治罪，其餘的都被寬恕。
第二年，京官考核，南京科道抨擊舒化。
于是他多次上疏請求回鄉，皇帝不同意。
遇上考察囚犯的事，他又開始辦公。
宦官中的貴人傳達皇帝的旨意要寬恕三十多名死囚，舒化争辯主張不寬恕。
诏令最後依從了他的建議。
不久他稱病重，于是回到家鄉。
去世後，贈封為太子少保，谥号莊僖。