股肱啊！君臣本為一體，元首雖然重要，也要依靠股肱心腹耳目的幫助，現在卻自塞耳目、自離心腹、自傷股肱，陛下将和誰一起共同治理天下的事情？
“君主受命于天，跟臣子受命于君，道理是一樣的。
言官本沒有大罪，陛下一旦震怒，就定他們失職罪，沒有一個人敢違抗命令。
既然大失人心，一定違背了上天的旨意。
萬一上天震怒，因陛下不郊天不祭祖、不上朝不朝講、不惜賢才、不看輕錢财，追究陛下失人君之職，而赫然降下非同尋常的災難，不知道陛下那時還能否違抗天命麼？臣子不能違抗君主，君主不能違抗上天，這道理十分明白，陛下難道不思為國家社稷打算嗎？”
皇帝大怒，也将他貶官三級，派往外地。
馬經綸被貶之後，工科都給事中海陽林熙春等人上疏說：“陛下氣憤言官緘默，排斥驅逐三十餘人，臣等不勝驚恐。
現在禦史馬經綸慷慨陳言，臣等竊以為陛下一定會對他溫旨褒獎，沒想到也跟着被貶斥。
這是因為提建議有罪呢，還是因為不提建議有罪呢？臣等不能理解。
先前怪罪的，既然是由于不說的緣故，當今所怪罪的，又因為敢說的緣故，這真是叫臣等無所适從啊！陛下若真以不進言為失職，則臣等不難進憂危的苦詞；若以直言為逆旨，則臣等不難仿效暗中保持緘默的成習。
隻怕朝廷之上，全都阿谀奉承以讨陛下的歡心，這不是君主的福氣啊。
臣等富貴榮辱的心念難道與常人不同？然而臣等甯願直言進谏而不願阿谀奉承，隻不過是沐浴了二百餘年來大明的養士之恩，不辜負君父，并且不辜負此生罷了。
陛下為什麼要深惡痛絕，如此折辱臣等啊？”皇帝更加惱怒，貶林熙春為茶鹽判官，加倍貶斥馬經綸為典史。
林熙春于是稱病離職。
這一天，禦史定興鹿久征等人也上疏，請求與各臣同罪，被貶為澤州判官。
二疏列有數十人的名字，全部都剝奪俸祿。
不久，南京禦史東莞林培上疏陳述時政。
皇帝追怒馬經綸，竟将他貶為平民。
回家鄉之後，閉門隐居達十年之久。
馬經綸死後，他的門人私下谥号為聞道先生。
天啟初年，恢複馬經綸的官銜，贈為太仆少卿。