書那天，沒有經過約定而彙集在一起的有幾萬人，都拿着香為周順昌乞求性命。
生員文震亨、楊廷樞、王節、劉羽翰等人前去拜見毛一鹭和巡按禦史徐吉，請求他們把這裡人民的情緒上報給皇帝知道。
旗官厲聲罵道：“東廠抓人，你們這幫鼠輩敢怎麼樣！”大聲叫喊：“囚犯在哪裡？”将鐵鎖鍊使勁往地下一丢，發出很響的聲音。
衆人更加氣憤，說：“開始我們以為是皇帝的命令，原來是東廠啊！”大聲叫喊着一擁而上，那形勢，真像排山倒海一般。
旗官東逃西竄，衆人來回痛打，打死一人，其餘的身負重傷，翻牆逃跑了。
毛一鹭、徐吉不能說話。
知府寇鎮、知縣陳文瑞一向很得人心，多方解釋，大家才離去。
周順昌于是投案自首。
又過了三天向北進發，毛一鹭用急報的奏章報告事變，東廠刺探情報的人說整個蘇州的人民都造反了，他們計劃截斷水道，劫持漕運糧食的木船，魏忠賢非常恐慌，不久毛一鹭說逮住了倡導暴亂的顔佩韋、馬傑、沈揚、楊念如、周文元等人，叛亂已經平定，魏忠賢這才放下心來。
然而從這以後，黃衣使者再也不敢邁出京城城門了。
周順昌到達北京，下诏入獄。
許顯純拷打逼供羅織罪名，坐贓款三千兩，五天嚴刑拷打一次。
每逢拷問，周順昌一定大罵魏忠賢。
許顯純敲掉他的牙齒，站起來問道：“看你還能不能罵魏上公？”周順昌把滿口的血水吐在他臉上，罵聲更加猛烈了。
于是在晚上偷偷地把周順昌殺害了。
這時是天啟六年(1626)六月十七日。
第二年，莊烈帝即位，倪文煥伏法被處死，李實下獄，毛一鹭、徐吉因修建魏忠賢祠堂被定罪，呂純如因頌揚太監被處罪，一起附于“逆案”。
追贈周順昌為太常卿，蔭封他的一個兒子做官。
給事中瞿式耜上訴各臣的冤情，稱贊周順昌和楊漣、魏大中的清廉忠誠尤其顯著，下诏谥号恭介。