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請無論軍種民種，一律照民田征收田賦！”莊烈帝同意了他的意見。
在此之前，魏忠賢亂政，邊饷多缺，自嚴這時卻按期供應。
自嚴還曾經上書說：“最浪費錢财的莫過于客兵的銀饷。
各邊鎮每年的例額總共是三百二十七萬兩，客兵的銀饷就占了三分之一，應該狠心把它減下來。
其次就是撫賞、召買、修築等費用，都不能不節省。
”莊烈帝以贊揚的口氣接受了。
這年冬天，京師受到攻打，莊烈帝憂勞國事，半夜裡能發出幾道聖旨過來。
自嚴做出的回答毫無遲疑，不敢放下心來睡覺，因此腦袋、眼睛都腫了，幸好沒有什麼缺少的東西。
第二年夏天，他以六條罪過自我批評，請求離職，莊烈帝好心地加以安慰、挽留。
以前因為考滿自嚴已加官太子少保，現在朝廷評定遵化、永平戰勝敵人得到收複的功勞，又給他加官為太子太保。
兵部尚書梁廷棟請加收全國的田賦，自嚴沒能加以制止。
于是除原先增加過的五百二十萬之外，又加收一百六十五萬多，天下百姓更加困耗了。
後來自嚴就當時政務提出了十條意見，主旨是為了利民，莊烈帝都采納了。
又因為兵饷一天天增加，自嚴幾次請求加以清查，可是兵部及總督、巡撫大都把這件事給擱在一邊。
自嚴又請求裁減内地用不着的軍隊，莊烈帝就傳令嚴加整頓，但是并不能全面推行下去。
禦史餘應桂彈劾自嚴在殿試讀卷時推薦陳于泰為第一。
于泰是輔臣周延儒的兒女親家。
自嚴稱病請求退休，書上了四次，莊烈帝不同意。
當時朝廷有令，縣令要報請吏部升用時，戶部要先核算他的錢谷征收情況。
華亭知縣鄭友元已經入朝當上禦史，以前擔任青浦知縣時欠收二千九百兩金花銀。
莊烈帝向戶部質問這件事，自嚴說友元已經交了十分之七存在太倉裡。
莊烈帝讓管倉庫的人核實，沒有，就怒氣沖沖地批評自嚴。
自嚴轉彎抹角地辯解，莊烈帝更惱了，就把他打入監獄，又派使者去逮捕友元。
禦史李若谠上書論救，莊烈帝不聽。
過了一個月，給事中吳甘來又抗章論救，莊烈帝才把他釋放出來。
八年(1635)五月，朝廷評定四川平賊的功勞時，恢複了自嚴的官籍，讓他退休了。
又過了三年，自嚴去世，朝廷按規定給他賜以恤典。