巫山的頂峰，向下俯瞰我們的軍營，再用強勁的騎兵居高臨下，俯沖下來，張令一定會被打敗，張令敗後再來打我，我失敗後還能解救重慶的危急嗎？況且督師把四川當作溝壑，想把賊兵都趕到四川來，這一點無論聰明人還是愚蠢人都知道。
邵公不在這個時候争山奪險，迫使賊兵不敢來攻擊我們，卻一味在這裡進行消極防守，這是必敗之路啊。
”遜之認為這話說得很對。
不多久捷春把軍營遷移到大昌，監軍萬元吉也屯兵巫山，與良玉相互呼應。
那年十月，張獻忠在觀音岩、三黃嶺連連打敗官軍，接着從上馬渡過江進兵，良玉偕同張令急忙在竹菌坪扼制他們，挫敗了他們的前鋒。
當張令被賊兵殺死時，良玉前去援救沒有成功，輾轉作戰又失敗了，部下的三萬人幾乎全部死光。
于是單槍匹馬去向捷春請求說：“情況緊急了，把我溪峒的士兵全部調出，還可以有二萬人。
我自拿出一半糧饷，其餘一半如果能向官府支取，就可以繼續剿賊。
”捷春看到嗣昌與自己不和，而倉庫中沒有現成的糧食，謝絕她的計策，沒有采用。
良玉就隻好歎息而歸。
當時搖天動、黃龍等十三家賊兵在四川橫行。
有一個叫秦缵勳的人，是良玉的族人，給賊兵當了耳目，被捉拿後殺死獄卒逃跑了。
良玉抓獲了他，把他交給了官府，他的手下也沒有一個逃脫。
張獻忠完全占領湖北，打算再一次進入四川。
良玉畫出全四川的形勢上呈給巡撫陳士奇，請增派兵力守住三個關隘，士奇沒能聽她的建議。
良玉又上呈給巡按劉之勃，之勃贊同他的建議，但是沒有多餘的兵力可以撥出來。
十七年春天，張獻忠就長驅直入進犯夔州。
良玉騎馬前往援助，由于寡不敵衆，敗退回來。
等到全四川都失陷以後，良玉對她的部下慷慨激昂地說“：我的兄弟兩個人都為國事而死，我作為一個孱弱的婦道人家，蒙受國恩達二十年之久，現在不幸到了這個地步，怎麼敢拿所剩不多的年月來投靠賊寇呢？”她召集部下的将士給他們訂立規約說：“有跟随賊兵走的，堅決殺而不赦！”接着分兵把守四處邊界。
賊兵在四川到處招納土司，卻沒有人敢到石石主來。
後來張獻忠死了，良玉竟然享盡天年才去世。
翼明罷官後，又在崇祯十六年(1643)冬天被朝廷起複為四川總兵官，因為道路阻塞，任命狀沒能傳到他手裡來。
拱明碰上普名聲叛亂，在與賊寇作戰時死掉，朝廷按規定給他進行了追贈和撫恤。