蛟、光先以及祖大弼、孫顯祖聯合出擊。
四月十五日，官軍進入山中，在郭家壩與賊兵相遇，天正下着大雨，各位将領竭力作戰，賊兵死傷不計其數。
後來因為糧食吃光他們隻好率兵返回。
九月，階州陷落，變蛟與光先同時被扣發了俸祿。
不多久被提升為都督佥事，擔任臨洮總兵官。
這個時候，承疇和傳庭一起發誓要消滅賊兵，傳庭在東面作戰，承疇在西面，東面的賊兵幾乎全部被剿滅完了，在西面的賊兵又從階州、成縣出擊西和與禮縣。
光先、顯祖都沒有立什麼戰功，隻有變蛟降服了小紅狼。
剩餘的賊兵逃竄到徽州、西當、成縣、鳳縣一帶，不敢大肆逞兇了。
十月，賊兵窺測到四川兵力空虛，就占領了甯羌州，分兵三路，連續占領了三十多個州縣。
承疇率領變蛟從沔縣經過甯羌，翻過七盤、朝天兩座山關，由于山高路窄，軍馬饑餓疲勞，年底才抵達廣元，賊寇已經返回去陝西。
變蛟等返回攔截，斬獲五百多首級。
當時兵部尚書楊嗣昌創立了“四正六隅”的戰略計劃，限期三個月剿盡賊兵。
十一年四月因為逾期未能消滅賊兵，對各級官兵遍行降罰，朝廷把變蛟、光先貶官三級，讓他們戴罪辦理剿賊事務。
賊兵再次進入陝西以後，他們的首領有一個号稱六隊的，同大天王、混天王、軍管王四部聯合向東進犯。
混天星、過天星兩支隊伍仍然潛伏在階州、文縣兩地，隻有闖王李自成在三月裡從洮州出兵西番。
承疇命令變蛟同賀人龍追擊他們，連續作戰，共斬敵六千七百多首級。
西番地面上缺少糧食，賊兵死亡很多。
變蛟轉戰千裡，身穿的铠甲有二十七個晝夜沒有解下過。
剩下的賊兵敗逃到邊塞上去了。
大弼駐守洮州，扼防賊兵不夠得力，給他們逃到岷州以及西和、禮縣一帶的山中。
變蛟返回圍剿，賊兵躲藏起來，不敢出戰，隻有六隊的勢力還很嚣張。
六月，光先從固原出兵，賊兵已逃到隴州、清水。
光先追到秦州，六隊同争管王又逃到成縣、階州，被變蛟遏制住。
他們的分支部隊号稱三隊的及仁義王、混天王的賊群向光先投降了，而自成、六隊及其同黨祁總管避開陝西的官兵，又謀劃進犯四川