邵寶邀到左順門，對他進行威脅，張彩、曹元自内出來對邵寶說：“你彈劾了平江伯，以後就沒事了。
”寶回答說：“平江伯是功臣之後，他總督漕運不久，沒有大的過失，不知彈劾他什麼。
”張、曹二人啞口無言，過了三天，給事中彈劾陳熊和邵寶，勒令他辭官返家。
劉瑾被誅後，朝廷又起用邵寶，巡撫貴州，不久調任戶部右侍郎，進升左侍郎，又命他兼左佥都禦史，處置糧運事宜。
又參與聯合勘察通川城濠。
不久，奏請回家奉養父母，禦史唐鳳儀、葉忠等奏請留用，于是拜為南京禮部尚書。
他再次上疏辭職。
世宗即位，起任前官，他再次懇請辭職，回家奉養老母，世宗允準。
以後逝于家中，贈太子太保，谥文莊。
邵寶三歲喪父，對母親過氏至孝。
剛十歲時，母親有病，他撰文祝告天地，願減短自己的生命而使母親益壽延年。
後來辭官歸家奉養母親時，他左手已麻木，但仍從早到晚侍奉母親，從不懈怠。
其學問以程朱之學為本，曾說：“我願做個名符其實的士大夫，不願為假道學。
”年輕時在南畿中舉，受到李東陽的賞識。
其詩文典雅，效法東陽。
他博覽群書，一有心得便記述下來，取程子“今日格一物，明日格一物”之義，因取名為“日格子”。
其著作有《學史錄》、《簡端錄》。
巡撫吳廷舉将此二書進呈朝廷。
此外還有《定性書說》、《漕政舉要》諸集若幹卷。
學者稱他為“二泉先生”。