大夫、柱國，兼支給大學士俸祿，庇蔭他的兒子世恩為尚寶丞。
後又以逢聖誕加恩，給他伯爵的俸祿，授予他的徒弟郭弘經、王永甯為高士。
當時都禦史胡缵宗入獄，株連數十人。
二十九年(1550)春，京師災異頻繁出現，皇上詢問仲文。
仲文回答說怕有冤獄，得雨才能消災。
不久法司上呈胡缵宗等人的判決書，皇上全部從輕治罪，天果然下了雨。
于是以平獄之功，封仲文為恭誠伯，歲祿一千二百石，郭弘經、王永甯也被封為真人。
追戮仇鸾時，下诏稱贊仲文之功，增給俸祿一百石，庇蔭兒子世昌為國子監生。
三十二年(1553)，仲文說：“齊河縣道士張演升建大清橋，疏浚河道時得一塊龍骨，重一千斤。
又突出石沙一脈，長數丈，像是有神相。
”皇上即發庫銀資助他。
當時在湖廣太和山建元嶽，建成後，皇上派英國公張溶前往行安神之禮，仲文偕同顧可學建醮祈福。
第二年皇上聖誕時，給仲文加恩，庇蔭兒子為錦衣衛百戶。
皇上更祈求長生，日夜禱祭，挑選文武大臣入西苑當值，供奉青詞。
四方奸人段朝用、龔可佩、藍道行、王金、胡大順、藍田玉之流，都以燒煉符咒熒惑天子，但不久皆敗，隻有仲文恩寵日隆，久而不衰，不少士大夫都靠他得以進用。
他又創二龍不相見之說，緻使皇朝長達二十年不立太子。
三十五年(1556)，皇上上皇考道号為三天金阙無上玉黨都仙法王玄元道德哲慧聖尊開真仁化大帝，皇妣号為三天金阙無上玉堂總仙法主玄元道德哲慧聖母天後掌仙妙化元君，皇上自号靈霄上清統雷元陽妙一飛玄真君，後來又加号九天弘教普濟生靈掌陰陽功過大道思仁紫極仙翁一陽真人元虛玄應開化伏魔忠孝帝君，再号太上丈羅天仙紫極長生聖智昭靈統元證應玉虛總掌五雷大真人玄都境萬壽帝君。
第二年，仲文有病，請求回山，獻上曆年所賜的蟒玉、金寶、法冠和一萬兩白金。
他回去後，皇上很懷念他，派錦衣衛官員去慰問，命有關官員經常給他加禮，改任他的兒子尚寶少卿世恩為太常寺丞兼道錄右演法，供事于真人府。
仲文得寵二十年，位極人臣，但他小心謹慎，不敢肆意妄為。
三十九年(1560)仲文去世，享年八十餘歲。
皇上得知後非常悲痛，仿邵元節之例賜給葬祭，特谥為榮康惠肅。
世恩後來任太常寺卿。
隆慶元年(1567)判他和王金僞造藥物之罪，下獄判了死罪。
仲文的官階谥号也被追削。