是他們既然已前來獻貢，又送還從中國擄掠去的人口，實在是有畏罪之心、請恩之意。
應該以禮遣送其使者回去，讓他們谕告源義鎮和源義長，要源義鎮和源義長轉告日本國王，讓他将倡導将到中國作亂的諸渠長擒拿後獻到朝廷，将逃到日本的中國奸宄之徒一并擒送到京都來，才答應與他們通貢貿易。
”皇帝下诏同意。
汪直盤踞在海島上，與其黨徒王氵敖、葉宗滿、謝和和王清溪等人，各倚仗倭寇稱雄。
朝廷甚至給他懸賞伯爵的爵位和黃金一萬兩，讓他回來，他也不回。
到此時，内地的官軍已頗有防備，倭賊雖然橫行，亦多遭官軍的剿戮，甚至還有全島倭賊出來後竟沒有一人生還的。
于是倭賊往往埋怨汪直，汪直漸漸感到不安。
胡宗憲與汪直同郡，便把汪直的母親和家小都安置到杭州居住，派蔣洲持汪直的家書前去招撫汪直。
汪直知道自己的家屬平安無事後，頗為心動。
源義鎮等人也因中國答應與他們互相開展貿易，也頗為高興，于是他們裝了一大船貨，派其屬下善妙等四十多人随汪直等人前來獻貢和貿易，在三十六年(1557)十月初抵達舟山的岑港。
當地的将吏以為是倭賊入寇，便陳兵防備。
汪直便派王氵敖去見胡宗憲，說：“我們是為通好而來的，為何布兵迎接我們？”王氵敖就是毛海峰，汪直的養子。
胡宗憲對他厚加慰勞，指心發誓沒有其他意思。
過了一會兒，善妙等人到舟山去拜見副将盧镗，盧镗讓善妙把汪直拿住獻給朝廷。
此語洩露後，汪直更加疑慮。
胡宗憲百方開導，汪直始終不信，說：“果然像你所說的那樣，可派王氵敖出來，我就登岸前來拜見。
”胡宗憲立刻把王氵敖遣送出來。
汪直又邀一名貴官為人質，胡宗憲便命令指揮夏正前去。
汪直認為可信，便與葉宗滿、王清溪一起來拜見。
胡宗憲大喜，對他們以厚禮相接，并讓他們到杭州去拜谒巡按禦史王本固，王本固則把汪直等人交給下屬官吏處置。
王氵敖等人聽到消息後，大恨，肢解了夏正，焚船登上山頭，占據岑港。
過了一年，新的倭寇大批湧來，屢次進犯浙東三個郡。
岑港的倭賊便慢慢轉移到柯梅，建造新船後出海，胡宗憲也不追擊他們。
十一月，倭賊揚帆往南而去，停泊在泉州的浯嶼，搶劫同安、惠安、南安各縣，攻打福甯州，攻破了福安、甯德等地。
第二年四月倭賊包圍了福州，時間長達一個多月。
福清、永福各城也都遭倭寇攻毀，倭賊還騷擾興化，在漳州地區奔突往來。
這樣倭寇之患全轉移到福建，而潮州、廣州間也紛紛有倭警傳來。
到四十年(1561)，浙東和長江以北的諸寇亂相繼平定。
胡宗憲不久因罪被逮捕下獄。
第二年十一月，倭賊攻陷興化府，進行大肆殺戮搶劫後，移居平海衛，不離開了。
當初，倭賊進犯浙江時，攻破州縣衛所的城池數以百計，但卻沒有攻破府城的。
這次興化府失陷，遠近都受到極大震動，朝廷便急忙征調俞大猷、戚繼光、劉顯等将領合兵攻擊，大敗了倭賊。
而侵犯其他州縣的倭賊也被各将攻破，福建的倭患也被平定了。
此後，廣東的巨寇曾一本、黃朝太等人，無不勾引倭賊作為自己的援助。
隆慶時期(1567～1572)，他們攻破了碣石、甲子等衛所。
之後，他們又進犯化州的石城縣，攻陷錦囊所和神電所。
吳川、陽江、茂名、海豐、新甯、惠來各縣，也都遭受他們的焚燒搶劫。
他們又轉而進入雷州、廉州和瓊州，這三郡也遭受其亂。
萬曆二年(1574)倭賊進犯浙東的甯波、紹興、台州、溫州四個郡，接着又攻陷廣東的銅鼓石、雙魚所。
三年(1575)進犯電白。
四年(1576)進犯定海。
八年(1580)倭賊進犯浙江的韭山和福建的澎湖、東湧等地。
十年(1582)進犯溫州，後來又進犯廣東。
十六年進犯浙江。
但此時的海疆官吏已以嘉靖年間的禍亂引以為戒，海防頗為嚴密，倭賊來犯總是失利而回。
侵犯廣東的倭賊，是受譙民梁本豪的勾引所緻，勢力尤為猖獗。
總督陳瑞集結各軍攻擊倭賊，斬殺了他們一千六百多人，擊沉他們的船隻一百餘艘，梁本豪也被斬首。
皇帝為此到郊廟告謝祖宗，宣告大捷并接受大臣們的祝賀。
日本以前有王，王之下最尊貴的是關白。
此時山城州的渠長信長就是關白。
有一天信長偶然出去狩獵，遇到一個人躺在樹下，該人受驚後起來與信長發生沖突，信長把他抓起來審問。
該人自稱是平秀吉，薩摩州人的奴隸，體魄雄健，身法矯捷，頗有辯才。
信長喜歡他，讓他牧馬，給他取名叫木下人。
後來漸漸讓他辦事，替信長出謀劃策，奪取兼并了二十幾個州，于是被信長委任為攝津的鎮守大将。
有個參謀叫阿奇支，因得罪了信長，信長便命令平秀吉帶兵前去征讨。
不久信長被其手下的大臣明智所殺。
平秀吉剛好消滅了阿奇支，聽說了事變後，與自己的部将行長等人乘勝回兵誅殺明智，于是威名更振。
不久平秀吉廢除了信長的三個兒子，自己稱為關白，把信長的原有勢力全收歸到自己的手中，這時是萬曆十四年(1586)。
從此他更加整肅軍隊，征服了六十六個州，又以兵力威脅琉球、呂宋、暹羅、佛郎機等國，讓這些國家給日本獻貢。
平秀吉又将國王所居的山城改為大閣，廣築城郭，興建宮殿，其樓閣有建至九重的，其中珍藏有婦女和珍寶。
平秀吉行事法度森嚴，軍隊打仗有進無退，違反者不管是自己的兒子還是女婿都必誅死，所以他的軍隊所向無敵。
平秀吉還将紀元改為文祿，想入侵中國，滅亡并占有朝鮮國。
他召見并詢問過以前汪直所留下的餘黨，了解到漢人像害怕虎狼一樣害怕倭人，于是其氣勢益發驕橫。
他大治武器，擴軍備戰，修繕船艦，與其屬下謀劃，入侵中國北京的用朝鮮人做向導，入侵浙江、福建沿海郡縣的則用漢人做向導。
他怕琉球會洩露該密謀，不讓琉球向明朝廷獻貢。
有個同安人名叫陳甲，在琉球經商。
他怕遭到中國的迫害，便與琉球長史鄭迥謀劃，借進貢之際請求朝廷封他為使者，把日本國的情況上報朝廷。
陳甲又回故鄉，将此情況告訴了巡撫趙參魯。
趙參魯将此上奏給皇帝，皇帝交給兵部，兵部則移咨文給朝鮮國王。
朝鮮國王卻隻辯解說所謂以朝鮮人為日本人入侵北京做向導是誣陷，也不知道日本人正在謀劃吞并自己的國家。
原先，平秀吉廣泛征集各鎮的軍隊，儲備了三年的糧食，想自己帶兵進犯中國。
此時正好碰上他的兒子死亡，身旁又沒有兄弟可以托付。
此前平秀吉又将豐後島的主妻奪來做自己的妾，怕豐後島成為自己的後患。
而各鎮也都埋怨平秀吉為人暴虐，都說：“這次征兵不是去襲擊大唐，而是襲擊我們哪。
”于是心裡各懷異志。
于是，平秀吉不敢親自帶兵出國作戰。
二十年(1592)四月，平秀吉派遣他手下的大将清正、行長和義智，以及僧人玄蘇、宗逸等，率戰船數百艘，從對馬島渡海攻陷了朝鮮的釜山，然後乘勝長驅直入，五月渡過臨津，劫掠開城，分别攻陷豐德各郡。
朝鮮軍隊望風潰逃，清正等人便進逼王京。
朝鮮國王李日公放棄王京逃奔到平壤，後又逃奔到義州，派使臣絡繹不絕地向明朝廷告急。
倭軍于是進入王京，俘虜了朝鮮國的王妃和王子，并追擊到平壤，讓士兵肆行淫掠。
七月，明朝廷命令副總兵祖承訓赴朝鮮救援，與倭軍在平壤城外接戰，結果大敗，隻祖承訓一人幸免于死。
八月，朝廷便任命兵部侍郎宋應昌為經略，都督李如松為提督，率軍前往朝鮮讨伐倭人。
正當此時，甯夏之亂未平，而朝鮮的戰事又起，兵部尚書石星無計可施，便招募能說服倭人退兵之人前去偵探倭軍的虛實，于是嘉興人沈惟敬便應募。
石星即刻給他假封了一個遊擊将軍的頭銜，将他送到李如松的麾下聽用。
第二年，李如松的軍隊在平壤大捷，朝鮮國所失去的四個道一并被收複。
李如松乘勝進軍到碧蹄館，因失敗而退軍。
于是朝廷中封貢的議論又起，朝廷為補救軍事上的阙失便讓沈惟敬調解成和局，此事詳見本書《朝鮮傳》。
時間一久，平秀吉死，諸倭軍都揚帆回國，朝鮮之患也平息了。
但是自從關白侵略東邊國家開始，前後七年，喪失軍隊數十萬人，花費糧饷錢财數百萬，而明朝廷和朝鮮國的損失至今還無法算清。
到關白死亡，兵禍才停息，諸路倭軍也都退回島内守巢，東南地區這才稍有安枕之日。
縱覽整個明代，不與倭人來往的禁令一直很嚴，以至闾巷中的百姓互相争執時都責罵對方是倭賊，有的還拿倭賊來恫吓自己不聽話的小兒女。