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由于戰功轉任洛苑副使，江、淮、兩浙都大發運、擘畫茶鹽捕賊事；賜予紫袍、金帶、錢五十萬。
在此之前，三路轉運使各兼任其職，有時國庫積聚了許多糧食，但士兵們連船隻也不能保證，即使官府出錢雇傭男丁拉船，但當地人害怕這種勞役，因此每年上供的軍糧，不超過三百萬。
楊允恭将三路舟兵和運送的物資全部集中起來，讓各州選擇官吏，并全部集中起來，楊允恭才按照人員多少分發物資。
江、浙運送的東西，到達淮泗，再由淮、泗運送到京師，需花費一年的時間，上供的物資達六百萬擔。
淳化五年(994)，楊允恭轉任西京作坊使，起初，産茶的地方，老百姓運輸賦稅全部計算價值，然後由官府出售，不分精粗，全部運送榷務。
商人不肯出售，時間一長就将這些茶葉燒掉了。
楊允恭說“：竭盡老百姓的利益而奪取，聚集茶葉讓它腐爛最後抛棄它，不是一種好辦法。
”至道(995～997)初年，劉式上奏建議請求廢除長江一帶的榷務，允許商人過長江，讓他們自由賣私貨。
楊允恭認為長江沿岸各州茶葉新舊相雜，兩河各州風土，各有适用之處，不夾雜很多等級，就會使商人少利。
請求按照舊例在長江以北設置榷務，平均各等級，按每年給予供給。
此事下至三司，鹽鐵使陳恕等人認為楊允恭的建議正确，于是朝廷下诏遵從。
就任命楊允恭為發運使，開始改“擘畫”為“制置”，西京作坊副使李廷遂、著作佐郎王子輿一起任發運使。
巢、廬江二縣以往隸屬廬州，道路僻遠盜賊出沒，老百姓輸役勞命。
楊允恭請求在二縣建軍，诏令許可，以無為軍的數目為準。
淮南十八州軍，其中九州軍為禁鹽地，這樣鹽的價格比産鹽之地要高出許多，老百姓從販鹽中獲利，因而販鹽的人越來越多，以緻有的拿着兵器往來為盜。
楊允恭認為應當統一執法，于是上奏請求全部禁鹽，由朝廷派遣官吏主持此事。
此事下至三司，三司認為此事不行，楊允恭再三上奏此事，太宗才開始依從他。
這年，得到了巨萬之利。
楊允恭與王子輿、秦羲共同主管鹽茶之事，制定了許多條令法規，于是加以改變成為新法。
真宗即位，改任西京左藏庫使。
又上言川峽鐵錢的弊病，說：“凡是老百姓的田稅，從前交納銅錢一份的，現在也交納鐵錢一份；官吏士卒的俸祿以往給一份銅錢的，現在給五份鐵錢；用于交易旅行，那麼鐵錢十份，相當于銅錢一份。
老百姓的田稅，以一抵十，國家損失九成，官吏士卒的俸祿，以五抵一，國家又損失四成；吏卒得