呂公著字晦叔，壽州人。
從小嗜好學習，以至廢寝忘食。
父親呂夷簡對他器重驚異，說：“今後必定為王公輔臣。
”恩補奉禮郎，登進士第，召試館職，沒有赴任。
為颍州通判，郡守歐陽修與他結為講學之友。
後來歐陽修出使契丹，契丹主詢問中國學問德行之士，首先答以呂公著。
判吏部南曹，仁宗獎許他淡于名利，賜給五品官服。
被任為崇文院檢讨、同判太常寺。
壽星觀營造真宗神禦殿，呂公著說：“先帝已經有三神禦殿，但不停地建立，豈不是祭祀沒有豐厚父廟之義。
”進官知制诰，三次辭謝不受君命。
改任天章閣待制兼侍讀。
英宗親政，加呂公著官龍圖閣直學士。
正議論追崇濮王，有的打算稱呼皇伯考，呂公著說：“這是真宗所以稱呼太祖，怎麼能施于王。
”等到下诏稱親，而且分賜諱号，呂公著又說：“稱親則有二個父親的嫌疑，王諱可以避于上前，不應與七廟同諱。
”呂誨等人因論濮王離開朝廷，呂公著說：“陛下即皇位以來，納谏之風沒有彰揚，而且多次貶退谏官，何以風示天下？”英宗沒有聽從他的意見。
呂公著于是請求補外任，英宗說：“學士為朕所器重，怎麼能夠離開朝廷？”呂公著不停地請求，出任蔡州知州。
神宗即皇帝位，召呂公著為翰林學士、知通進銀台司。
司馬光因論事被解除禦史中丞的職務，回到經幄。
呂公著封還這個诏命說：“司馬光因舉職賜罷，這是為有言事職責的人不能盡其言。
”诏令以告示直接付給..門。
呂公著又說：“制命不由門下省，那麼封駁的職責，因我而廢棄。
希望治我的罪，以端正紀綱。
”神宗示谕他說“：之所以流放司馬光的原因，是依賴他勸學而已，不是因為言事的緣故。
”呂公著不停地請求，終于解除知通進銀台司的職務。
熙甯初年，呂公著知開封府。
當時夏秋久雨，京師發生地震。
呂公著上疏說“：過去人君遇災，有的恐懼以緻福，有的簡誣以緻禍。
陛下以至誠待臣下，那麼臣下思慮盡誠以回報，上下至誠而變異不消失的，從來沒有。
做人君主的隻有除去偏聽獨任的弊端，而不被先入之語所蒙蔽，那麼就不會被邪說所亂。
顔淵問為邦國之道，孔子答以疏遠奸佞之人為戒。
大概奸佞之人惟恐不順合君意，那麼其勢必容易親近，正直的人惟恐不符合大義，那麼其勢必容易疏遠。
隻有首先格王端正此事，沒有事正而世不治理的。
”禮官遵用唐代舊例，請求五月臨禦大慶殿接受朝拜，因而上尊号。
呂公著說：“陛下正超越漢、唐，追複三代，何必在陰盛的日子，為不符合禮義的朝會，接受無益的虛