他的兒子王慶鈞以及門客仆從，仗勢恃強，所作的許多不法之事。
在他看，最惡毒的是，以為慈禧太後因為他的“奉職無狀”而“宵旰憂勞”，當此秋風多厲之際，亦不得安然怡養。
這一挑撥，如果忽視，則慈眷一衰，真的可能有不測之禍。
于是，當天他就上了個奏請開缺的折子。
慈禧太後胸有成竹，降旨慰留，預期着張佩綸必不罷休，要看他第二個折子，說些什麼？
張佩綸的第二個折子，對王文韶展開正面的攻擊，措詞運用，卻另有巧妙。
共是一折一片，折子上說他才具不勝，如果慈禧太後據以罷斥，則發抄原折，可以不提雲南報銷案的弊端，對王文韶還算是顧面子。
但要說服慈禧太後，則又非提雲南報銷案的弊端不可，因而加一個附片，指出雲南報銷案三可疑：
第一疑：“王文韶曾在雲南司派辦處行走，報銷之弊，當所稔知。
此案既緻人言，必有書吏在内，若于奉旨之日，即密饬司員将承辦書吏，羁管候傳，抑或押送刑部，豈不光明磊落，群疑盡釋？乃谳傳函牍屢傳，機事不密，任令遠揚，歸過司員，全無作色。
人或曰：文韶機警，何獨于書吏則不機警？”
第二疑：“雲南此案報銷，将歲支雜款，全行納入軍需，本非常科，即疆吏聲叙在先，亦宜奏駁，既已含混複準，經言者論劾，若戶部即請簡派大臣複核，則過出無心，猶可共諒。
乃至戶部堂官奏請複核，始與景廉面懇回避。
風聞銀數出入，散總不甚相符，且事先迅催兵工兩部，不及候複，率先奏結，尤為情弊顯然。
人或曰：文韶精密，何獨于報銷則不精密？”
第三疑：“崔尊彜、潘英章為此案罪魁禍首，既據商人供稱：彙款系為報銷。
狀證确鑿，該兩員即屬有玷官箴。
周瑞清已經解任，該兩員不先革職，亦當暫行開缺，乃疊降明谕，但曰：‘嚴催解送’。
他樞臣即未見及，王文韶若欲自明，何以默不一語？人或曰：文韶明白，何獨于該兩員處分則不明白？”
字裡行間的指責，慈禧太後當然看得出來，第二疑暫且不論，第一疑指王文韶故意放書辦逃走，意在消滅罪證。
第三疑是指王文韶包庇崔尊彜、潘英章。
衡情度理，确有可疑。
因此，持着這一折一片，慈禧太後開始認真考慮讓王文韶走路。
繼任人選，倒是早就想好了的，此刻還要考慮的是，張佩綸分析事理，精到細緻，不光是會罵人、會說大話。
然則該當如何重用？
思考未定，便隻有暫且擱置，于是王文韶第二次上折辭官，又蒙慰留。
但語氣跟前不同了，說“覽其所奏各情，本應俯如所請。
不過軍機處及總理各國事務辦事需人，王文韶尚稱熟悉，着仍遵前旨，于假滿後照常入直。
”
這“尚稱熟悉”四個字，是軍機章京看風頭所下的貶詞，經寶鋆和李鴻藻商量過，奏請裁可而見諸明發上谕的。
熟悉朝章故事的，一看王文韶落得這四個字的考語，就知道他非出軍機不可了。
王文韶自己卻有些拿不定主意，因為他的親族故舊，門客僚屬，平素出入門下的一班人，聚訟紛纭，意見甚多。
主張自己知趣，及早抽身的固多，認為反正面子已經丢完了，裡子不能不要也有，慈禧太後雖然精明，到底是婦人心慈，不見得會聽信張佩綸的話，罷斥樞臣。
再有一派認為要引退也得等些時候，張佩綸一上彈章，随即請辭，看來完全受他擺布，面子上未免太下不去。
王文韶對這個看法，頗有同感，還想看看再說，無奈壞消息不一而足。
先是江蘇巡撫衛榮光奏報，據崔尊彜的家丁呈報，說他家主人在丹徒縣旅途病故。
丹徒縣就是鎮江府城，雖為循運河入長江、到皖南的必經之地，但崔尊彜死在九月，丹徒縣接到崔家家丁的呈報是在十月，何以在鎮江逗留如此之久，又何以遲一個月呈報，情節自然可疑，所以上谕命衛榮光确切查明，崔尊彜是否病故？
其實用不着查，與衛榮光的奏報同時傳到京裡的消息，說崔尊彜是服毒自殺的，這就見得情虛畏罪了。
趙舒翹聽得這話，大為緊張，案中兩名要犯，已經去了一個，如果潘英章步崔尊彜的後塵，也來一個“病故”，那時死無對證，周瑞清可以逍遙法外，全案亦就永遠要懸在那裡，因而不能不采取斷然的手段。
他做事向來有擔當，也不必禀明堂官，将王敬臣和周瑞清的家丁譚升，秘密傳訊，軟哄硬逼，終于又榨出來一些内幕。
據譚升供認：崔、潘二人到京後，跟他家主人都常有往還。
這倒還不關緊要，王敬臣供出來一段事實，對周瑞清卻大為不利。
他說：潘英章從他那裡取去的銀票，其中有一張是由百川通票号來兌現的。
于是傳訊百川通的店東，承認周瑞清跟他的百川通有往來。
上年九月間，周瑞清拿來一張順天祥的票子，存入百川通，換用了他那裡的銀票，顯然的，這是周瑞清的一種手法，不願意直接使用順天祥的銀票，免得落個把柄。
此外王敬臣還說，有個戶部雲南司的“孫老爺”，也曾經拿潘英章用出去的票子，到他那裡取過銀子。
這都是“通賄有據”，戶部奏請将周瑞清暫行革職，以便傳訊。
戶部雲南司的“孫老爺”，是不是主稿的郎中孫家穆，自應查究，亦請先行解任。
照準的上谕一下，趙舒翹立即執行，親自帶人逮捕周瑞清，先送入戶部“火房”安置，不準家屬接見。
送進去的鋪蓋、用具、食物，無不仔細檢查，連饅頭都掰開來看過，怕内中夾着什麼紙條。
于是，第二天召見軍機，王文韶不能不再一次面奏，懇請準予開缺養親。
慈禧太後沒有準，也沒有不準，隻說：“先下去！另有旨意。
”
等軍機退了下去，跟着又“叫起”，指明隻要寶鋆和李鴻藻進見。
這是可以料想得到的，召見必是為了咨詢繼任王文韶的人選。
照例兩名漢軍機大臣一南一北，王文韶的遺缺應該挑南邊人來補，寶鋆夾袋中雖有人物，但資望都還差得遠，所以他很知趣，将這個人情賣了給李鴻藻。
“蘭翁，”他說：“一上去自然是談王夔石空下來的位子，凡有保薦，請你作主。
”
李鴻藻對這件事亦早就想過，但一直有左右為難之感，形勢很明顯地擺在那裡，不是翁同和就是潘祖蔭，潘祖蔭是會試同年，翁同和是弘德殿多年